18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0039 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  230  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  56.64 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  45.79 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  37.17 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  39 
 
 		 416 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  37.01 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  36.22 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  37.8 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  37.4 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0362  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.543281  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  37.01 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  35.58 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  41.49 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0250  hypothetical protein  36.51 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0247  hypothetical protein  36.51 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0244  hypothetical protein  34.92 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1712  hypothetical protein  31.87 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2221  hypothetical protein  28.4 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>