26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1005 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  851    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  40.83 
 
 
128 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  43.3 
 
 
139 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  40.43 
 
 
121 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  37.89 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  36.08 
 
 
123 aa  64.3  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  32.41 
 
 
144 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1712  hypothetical protein  37.65 
 
 
132 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  37.21 
 
 
128 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2221  hypothetical protein  36.47 
 
 
135 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0300466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  34.51 
 
 
140 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  33.63 
 
 
140 aa  50.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  32.35 
 
 
132 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0244  hypothetical protein  30.51 
 
 
154 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  33.04 
 
 
151 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0247  hypothetical protein  30.51 
 
 
154 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0250  hypothetical protein  30.51 
 
 
154 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046509 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  41.03 
 
 
1585 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0362  hypothetical protein  31.67 
 
 
154 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.543281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  32.74 
 
 
140 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  32.74 
 
 
140 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  35.48 
 
 
145 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  34.12 
 
 
870 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0933  hypothetical protein  36.47 
 
 
148 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8655  ankyrin repeat-containing protein  29.27 
 
 
350 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0073  ankyrin repeat-containing protein  29.49 
 
 
800 aa  43.1  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>