19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1316 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  243  9e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  41.38 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  39.37 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0247  hypothetical protein  36.92 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0244  hypothetical protein  36.92 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  36.84 
 
 
416 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  38.52 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0250  hypothetical protein  36.15 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  38.52 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  40.7 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0362  hypothetical protein  36.15 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.543281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  37.7 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  37.7 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  31.67 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  36.54 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1712  hypothetical protein  29.29 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  36.36 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>