17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0246 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  276  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  96.43 
 
 
140 aa  268  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  94.29 
 
 
140 aa  262  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  93.57 
 
 
140 aa  261  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0362  hypothetical protein  77.14 
 
 
154 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.543281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0247  hypothetical protein  77.14 
 
 
154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0244  hypothetical protein  77.14 
 
 
154 aa  210  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0250  hypothetical protein  76.43 
 
 
154 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  79.56 
 
 
151 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  37.72 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  37.6 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  39.25 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  37.17 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  38.61 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  35.4 
 
 
142 aa  53.9  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  34.51 
 
 
416 aa  51.6  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  35.48 
 
 
128 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>