19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0245 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  97.14 
 
 		 140 aa  270  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  96.43 
 
 		 140 aa  268  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  92.86 
 
 		 140 aa  259  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0362  hypothetical protein  73.94 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.543281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0244  hypothetical protein  75.71 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0247  hypothetical protein  75.71 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0250  hypothetical protein  75 
 
 		 154 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  76.26 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  38.79 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  42.11 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  38.05 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  36.59 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  37.62 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  34.51 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  32.74 
 
 		 416 aa  47.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  35.48 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  31.71 
 
 		 126 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  31.71 
 
 		 126 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>