19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3776 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  276  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  97.14 
 
 
140 aa  270  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  94.29 
 
 
140 aa  262  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  90.71 
 
 
140 aa  253  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0362  hypothetical protein  73.94 
 
 
154 aa  207  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.543281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0247  hypothetical protein  74.29 
 
 
154 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0244  hypothetical protein  74.29 
 
 
154 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  76.26 
 
 
151 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0250  hypothetical protein  73.57 
 
 
154 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  39.66 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  42.11 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  37.4 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  37.17 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  38.61 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  34.51 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  32.74 
 
 
416 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  35.48 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  31.71 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  31.71 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>