17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4482 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  276  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  93.57 
 
 		 140 aa  261  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  92.86 
 
 		 140 aa  259  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  90.71 
 
 		 140 aa  253  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0247  hypothetical protein  76.43 
 
 		 154 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0244  hypothetical protein  76.43 
 
 		 154 aa  209  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0250  hypothetical protein  75.71 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0362  hypothetical protein  73.94 
 
 		 154 aa  207  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.543281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  76.26 
 
 		 151 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  39.66 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  37.4 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  37.17 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  39.85 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  37.62 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  35.4 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  33.63 
 
 		 416 aa  50.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  37.23 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>