25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06623 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  39.25 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  38.89 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  37.86 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  37.89 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1712  hypothetical protein  40.22 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  36.08 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  31.79 
 
 
151 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0250  hypothetical protein  31.58 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0247  hypothetical protein  31.17 
 
 
154 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0244  hypothetical protein  31.37 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0362  hypothetical protein  31.5 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.543281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  39.36 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  34.51 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  35.4 
 
 
140 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  35.4 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  34.51 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  38.89 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2221  hypothetical protein  36.14 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0300466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  43.53 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0933  hypothetical protein  37.35 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19930  hypothetical protein  45.65 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00576069  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  34.04 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  34.04 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  36.67 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>