15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2221 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2221  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  256  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0933  hypothetical protein  82.11 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  51.82 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1712  hypothetical protein  51.16 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19930  hypothetical protein  51.92 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00576069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  32.38 
 
 		 416 aa  57  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  29.37 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  32.04 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  32.74 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  28.4 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  31.93 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  32.23 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>