32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1549 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  253  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  42.24 
 
 
144 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  51.65 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  40.83 
 
 
416 aa  91.3  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  48.94 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  39.66 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  39.66 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  38.79 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  37.72 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  39.25 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0362  hypothetical protein  36.29 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.543281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0244  hypothetical protein  34.68 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0250  hypothetical protein  34.68 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0247  hypothetical protein  34.68 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  42.5 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2221  hypothetical protein  29.79 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0300466 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  31.76 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  31.76 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2405  hypothetical protein  33.72 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  31.11 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  31.11 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2482  YjgA  28.09 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.881473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  27.71 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  29.76 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  29.76 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  28.09 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  31.33 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  28.92 
 
 
128 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>