29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0314 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  250  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  250  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  58.04 
 
 
128 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  58.04 
 
 
128 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  58.04 
 
 
128 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  58.93 
 
 
131 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  58.93 
 
 
131 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2849  hypothetical protein  55.17 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  58.93 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  55.17 
 
 
128 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  58.04 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  54.7 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2482  YjgA  55.36 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.881473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  54.31 
 
 
145 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  47.32 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2405  hypothetical protein  43.12 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4148  hypothetical protein  44.12 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0466486  normal  0.255709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
674 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1456  hypothetical protein  28.32 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332564  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1875  hypothetical protein  30.23 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  30.59 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3324  hypothetical protein  31.86 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491897  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  31.76 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1358  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105066  normal  0.725718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  31.71 
 
 
140 aa  43.9  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  34.04 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  31.71 
 
 
140 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22570  hypothetical protein  32.18 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  34.83 
 
 
416 aa  40  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>