36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1727 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  291  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  54.55 
 
 
128 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  52.5 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  51.67 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2482  YjgA  51.24 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.881473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  51.67 
 
 
128 aa  131  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  53.23 
 
 
128 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  51.67 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2849  hypothetical protein  51.67 
 
 
128 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  50.83 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  50.83 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  53.28 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  54.31 
 
 
126 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  54.31 
 
 
126 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  39.83 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1456  hypothetical protein  36.8 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332564  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2405  hypothetical protein  31.4 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4148  hypothetical protein  38.39 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0466486  normal  0.255709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
674 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1358  hypothetical protein  37.21 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105066  normal  0.725718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1257  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3165  hypothetical protein  32.54 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394705  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  27.71 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  30 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1875  hypothetical protein  30.34 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2981  hypothetical protein  33.66 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.371839 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  35.48 
 
 
416 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3207  hypothetical protein  33.66 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  36.67 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  29.91 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3324  hypothetical protein  29.66 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491897  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  31.03 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22570  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  33.9 
 
 
452 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1961  hypothetical protein  32.93 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1988  hypothetical protein  32.93 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000386532  normal  0.058084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>