26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3165 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3165  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394705  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3207  hypothetical protein  77.27 
 
 
184 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2981  hypothetical protein  76.36 
 
 
184 aa  158  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.371839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1875  hypothetical protein  57.85 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1456  hypothetical protein  55.08 
 
 
166 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332564  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 
674 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1358  hypothetical protein  60.64 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105066  normal  0.725718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  52.14 
 
 
452 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  32.28 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  30.23 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  34.78 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  31.5 
 
 
128 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  34.78 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  31.5 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  33.62 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2849  hypothetical protein  30.77 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  30.71 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2482  YjgA  27.91 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.881473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  32.54 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5052  hypothetical protein  37.61 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3324  hypothetical protein  34.18 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491897  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1961  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1988  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000386532  normal  0.058084 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  27.47 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  27.47 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>