46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0117 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  874    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4796  hypothetical protein  61.39 
 
 
309 aa  349  6e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5263  protein of unknown function DUF817  61.39 
 
 
309 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5339  protein of unknown function DUF817  64.39 
 
 
307 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.930782  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6773  hypothetical protein  61.45 
 
 
298 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277117  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1356  hypothetical protein  53.68 
 
 
294 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1728  hypothetical protein  54.4 
 
 
265 aa  280  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.718343  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3105  hypothetical protein  60.07 
 
 
324 aa  269  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.245287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1644  hypothetical protein  54.35 
 
 
285 aa  257  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2636  hypothetical protein  52.08 
 
 
342 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3287  protein of unknown function DUF817  50.94 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3567  hypothetical protein  51.52 
 
 
305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1584  hypothetical protein  42.24 
 
 
308 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6238  hypothetical protein  45.31 
 
 
271 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1090  hypothetical protein  42.97 
 
 
281 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1482  protein of unknown function DUF817  41.83 
 
 
286 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000581857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1038  protein of unknown function DUF817  39.34 
 
 
300 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3475  hypothetical protein  36.78 
 
 
254 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3505  hypothetical protein  37.86 
 
 
254 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3188  hypothetical protein  38.27 
 
 
254 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1773  hypothetical protein  37.86 
 
 
254 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000100092  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3488  hypothetical protein  38.27 
 
 
254 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000482446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3535  hypothetical protein  37.04 
 
 
254 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3278  hypothetical protein  37.04 
 
 
254 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000124839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3492  hypothetical protein  37.04 
 
 
254 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3248  hypothetical protein  37.04 
 
 
254 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000202947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3191  hypothetical protein  36.29 
 
 
254 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000002429  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0407  hypothetical protein  36.05 
 
 
259 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0304882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1875  hypothetical protein  50.93 
 
 
127 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3165  hypothetical protein  49.23 
 
 
129 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394705  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2981  hypothetical protein  49.59 
 
 
184 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.371839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3207  hypothetical protein  51.3 
 
 
184 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1456  hypothetical protein  51.38 
 
 
166 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332564  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 
674 aa  76.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1358  hypothetical protein  51.06 
 
 
140 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105066  normal  0.725718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  33.59 
 
 
127 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  31.86 
 
 
128 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  31.86 
 
 
128 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  32.17 
 
 
131 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  32.17 
 
 
131 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  31.86 
 
 
128 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  32.54 
 
 
145 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2849  hypothetical protein  30.97 
 
 
128 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  30.09 
 
 
128 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  31.86 
 
 
128 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>