30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3207 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3207  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  350  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2981  hypothetical protein  95.65 
 
 		 184 aa  283  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.371839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3165  hypothetical protein  77.34 
 
 		 129 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1875  hypothetical protein  55.47 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1456  hypothetical protein  56.52 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332564  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 		 674 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  50.74 
 
 		 452 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1358  hypothetical protein  63.04 
 
 		 140 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105066  normal  0.725718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  30.77 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  30.77 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  30.47 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3164  prevent-host-death family protein  76.47 
 
 		 84 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  29.69 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  29.69 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  28.91 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  31.15 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  34.86 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2849  hypothetical protein  31.01 
 
 		 128 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2482  YjgA  30 
 
 		 128 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.881473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2040  prevent-host-death family protein  70.59 
 
 		 84 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3324  hypothetical protein  27.82 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  31.67 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4834  prevent-host-death protein  48.48 
 
 		 83 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4183  prevent-host-death family protein  48.48 
 
 		 83 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3332  prevent-host-death family protein  48.48 
 
 		 83 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5052  hypothetical protein  36.67 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1988  hypothetical protein  25.71 
 
 		 140 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000386532  normal  0.058084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  29.32 
 
 		 132 aa  41.6  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2405  hypothetical protein  22.92 
 
 		 133 aa  41.6  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>