28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1456 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1456  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  324  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332564  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1358  hypothetical protein  81.43 
 
 
140 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105066  normal  0.725718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.38 
 
 
674 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1875  hypothetical protein  55.04 
 
 
127 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3207  hypothetical protein  57.02 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2981  hypothetical protein  56.2 
 
 
184 aa  97.1  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.371839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3165  hypothetical protein  55.08 
 
 
129 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394705  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  49.53 
 
 
452 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2849  hypothetical protein  35.2 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  32.52 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  32.52 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2482  YjgA  31.93 
 
 
128 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.881473 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  32.52 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  31.93 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  32.77 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  39.2 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  36.8 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  32.52 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  35.16 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2405  hypothetical protein  28.79 
 
 
133 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  28.32 
 
 
126 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  28.32 
 
 
126 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4148  hypothetical protein  31.53 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0466486  normal  0.255709 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5052  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1961  hypothetical protein  28.7 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1988  hypothetical protein  29.09 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000386532  normal  0.058084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>