23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1875 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1875  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  247  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1456  hypothetical protein  55.04 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332564  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.09 
 
 		 674 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3165  hypothetical protein  57.85 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3207  hypothetical protein  57.94 
 
 		 184 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1358  hypothetical protein  60.55 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105066  normal  0.725718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2981  hypothetical protein  56.07 
 
 		 184 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.371839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  51.96 
 
 		 452 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  30.23 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  30.23 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  34.88 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  30.34 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2482  YjgA  33.04 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.881473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  31.86 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  28.46 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  28.46 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  30.56 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  29.2 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2849  hypothetical protein  29.63 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  32.91 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>