31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2981 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2981  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  348  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.371839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3207  hypothetical protein  95.65 
 
 
184 aa  284  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3165  hypothetical protein  76.56 
 
 
129 aa  160  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394705  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1875  hypothetical protein  53.91 
 
 
127 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1456  hypothetical protein  55.8 
 
 
166 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332564  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 
674 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  50.34 
 
 
452 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1358  hypothetical protein  61.96 
 
 
140 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105066  normal  0.725718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  29.69 
 
 
128 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  28.91 
 
 
128 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  28.91 
 
 
128 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  30.47 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3164  prevent-host-death family protein  76.47 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332735  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  30.33 
 
 
128 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  28.12 
 
 
128 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  33.94 
 
 
127 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2849  hypothetical protein  30.23 
 
 
128 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2482  YjgA  29.23 
 
 
128 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.881473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  31.67 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3324  hypothetical protein  28.81 
 
 
134 aa  51.6  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491897  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2040  prevent-host-death family protein  67.65 
 
 
84 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5052  hypothetical protein  36.67 
 
 
132 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2405  hypothetical protein  23.61 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331587  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  30.08 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4834  prevent-host-death protein  45.45 
 
 
83 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4183  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 
83 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3332  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 
83 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  25.64 
 
 
126 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  25.64 
 
 
126 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>