23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4148 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4148  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  264  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0466486  normal  0.255709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0314  hypothetical protein  44.95 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0759109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0308  hypothetical protein  44.95 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  40.32 
 
 
128 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2849  hypothetical protein  39.52 
 
 
128 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  41.8 
 
 
128 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  40.98 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  40.87 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  42.62 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  40.87 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  40.98 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  40.98 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  39.34 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2482  YjgA  41.88 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.881473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  40.87 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2382  hypothetical protein  40.74 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79559  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2405  hypothetical protein  33.04 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1456  hypothetical protein  32.46 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332564  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
674 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1961  hypothetical protein  32.48 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1988  hypothetical protein  32.48 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000386532  normal  0.058084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3324  hypothetical protein  29.57 
 
 
134 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491897  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5052  hypothetical protein  29.47 
 
 
132 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>