17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19930 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_19930  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  293  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00576069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1712  hypothetical protein  84.85 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2221  hypothetical protein  53.21 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0933  hypothetical protein  53.1 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  39.31 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  43.3 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  31.48 
 
 		 416 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  28.8 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  35.77 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  30.77 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  35.77 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  35.34 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  35.77 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  30.61 
 
 		 139 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  31.18 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>