16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1712 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1712  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  248  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19930  hypothetical protein  84.85 
 
 
152 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00576069  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2221  hypothetical protein  53.21 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0300466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  42.62 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0933  hypothetical protein  51.79 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  37.12 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  34.62 
 
 
416 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  30.97 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  29.29 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0039  hypothetical protein  31.87 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  30.28 
 
 
128 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  32.65 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  33.81 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  35.61 
 
 
140 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  34.85 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>