20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0933 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  279  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2221  hypothetical protein  76.64 
 
 		 135 aa  174  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4158  hypothetical protein  47.62 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1712  hypothetical protein  51.16 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19930  hypothetical protein  51.89 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00576069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  32.23 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1005  hypothetical protein  37.89 
 
 		 416 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4482  hypothetical protein  35.54 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0246  hypothetical protein  35.54 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3776  hypothetical protein  32.23 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  33.9 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0244  hypothetical protein  33.6 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06623  hypothetical protein  35.35 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0245  hypothetical protein  32.54 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000864712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  34.94 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0362  hypothetical protein  32.28 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.543281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0244  hypothetical protein  32.03 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0247  hypothetical protein  32.03 
 
 		 154 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0250  hypothetical protein  32.03 
 
 		 154 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046509 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1316  hypothetical protein  32.14 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>