78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0011 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2146  protein of unknown function UPF0182  37.62 
 
 		 912 aa  640    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758786 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0011  hypothetical protein  98.47 
 
 		 918 aa  1836    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0011  hypothetical protein  100 
 
 		 918 aa  1860    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1797  hypothetical protein  37.06 
 
 		 932 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2689  hypothetical protein  36.54 
 
 		 890 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.958793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1139  hypothetical protein  34.15 
 
 		 909 aa  598  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.827602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1161  hypothetical protein  36.1 
 
 		 914 aa  594  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.100714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10710  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  34.6 
 
 		 917 aa  595  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2777  protein of unknown function UPF0182  37.3 
 
 		 960 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.740282  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4385  hypothetical protein  34.47 
 
 		 919 aa  579  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.182735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2333  hypothetical protein  34.68 
 
 		 894 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.280552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0902  hypothetical protein  35.14 
 
 		 892 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3567  hypothetical protein  35.91 
 
 		 900 aa  572  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00412787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1115  hypothetical protein  34.99 
 
 		 930 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2279  protein of unknown function UPF0182  34.39 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000442741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0814  protein of unknown function UPF0182  33.97 
 
 		 891 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.297672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1303  hypothetical protein  33.11 
 
 		 899 aa  550  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.939701  normal  0.0211961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0908  protein of unknown function UPF0182  32.41 
 
 		 945 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.747504  hitchhiker  0.000109139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3465  protein of unknown function UPF0182  32.73 
 
 		 896 aa  545  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0693  protein of unknown function UPF0182  36.43 
 
 		 909 aa  531  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0967  protein of unknown function UPF0182  33.06 
 
 		 959 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000819285  normal  0.392007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3693  hypothetical protein  34.83 
 
 		 996 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1951  hypothetical protein  35.29 
 
 		 988 aa  495  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1700  protein of unknown function UPF0182  31.82 
 
 		 893 aa  491  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4195  hypothetical protein  35.73 
 
 		 1004 aa  489  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0938  hypothetical protein  35.27 
 
 		 1019 aa  485  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4155  hypothetical protein  35.49 
 
 		 1004 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2722  hypothetical protein  35.24 
 
 		 991 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177747  hitchhiker  0.000114433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1783  hypothetical protein  34.41 
 
 		 955 aa  482  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.890136  normal  0.25047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5177  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1009 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2749  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1006 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8343  hypothetical protein  29.63 
 
 		 983 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.715387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3730  protein of unknown function UPF0182  28.96 
 
 		 968 aa  446  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2471  protein of unknown function UPF0182  29.05 
 
 		 985 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000003677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0945  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1035 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203937  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0698  protein of unknown function UPF0182  34.34 
 
 		 945 aa  429  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00837363  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0961  hypothetical protein  30.27 
 
 		 872 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0949388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4222  protein of unknown function UPF0182  28.19 
 
 		 985 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14990  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1047 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.589114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3781  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1018 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568022  normal  0.0630741 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1871  protein of unknown function UPF0182  27.85 
 
 		 949 aa  406  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2952  hypothetical protein  28.76 
 
 		 972 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0447926  normal  0.518899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3729  hypothetical protein  27.27 
 
 		 994 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14611  hypothetical protein  32.08 
 
 		 950 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1151  hypothetical protein  31.03 
 
 		 932 aa  392  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4110  hypothetical protein  26.71 
 
 		 993 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1193  protein of unknown function UPF0182  28.42 
 
 		 1019 aa  392  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111199  normal  0.0369409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0793  protein of unknown function UPF0182  27.47 
 
 		 1007 aa  382  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27470  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1012 aa  383  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2137  hypothetical protein  29.02 
 
 		 874 aa  379  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0489156 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2885  protein of unknown function UPF0182  27.47 
 
 		 980 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0941  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1001 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1599  protein of unknown function UPF0182  28.05 
 
 		 982 aa  379  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217724  normal  0.364231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19060  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1045 aa  373  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.569882  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0780  Na+-driven multidrug efflux pump  27.05 
 
 		 1079 aa  369  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07660  hypothetical protein  26.38 
 
 		 988 aa  364  4e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.580652  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0725  protein of unknown function UPF0182  26.13 
 
 		 1018 aa  362  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19540  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1029 aa  362  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139911  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0653  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1016 aa  359  9.999999999999999e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.523938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2716  hypothetical protein  29.66 
 
 		 992 aa  355  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107653  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1323  hypothetical protein  27.84 
 
 		 914 aa  345  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.707425  normal  0.117445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4654  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1004 aa  341  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13213  hypothetical protein  27.17 
 
 		 992 aa  340  7e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1814  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1002 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693843  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1469  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1001 aa  337  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1415  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1003 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1433  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1003 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3487  protein of unknown function UPF0182  27.06 
 
 		 994 aa  321  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7927  protein of unknown function UPF0182  25.18 
 
 		 962 aa  317  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3037  protein of unknown function UPF0182  25.59 
 
 		 985 aa  315  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1530  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1004 aa  311  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2461  protein of unknown function UPF0182  26.02 
 
 		 1000 aa  310  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.947136  hitchhiker  0.00000899121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4377  hypothetical protein  24.83 
 
 		 992 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10064  transmembrane protein  31.02 
 
 		 672 aa  266  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.849211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0541  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1018 aa  224  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3795  protein of unknown function UPF0182  29.12 
 
 		 1007 aa  213  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214749  normal  0.0401617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10063  transmembrane protein  24.81 
 
 		 346 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.477127  normal  0.782331 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0067  hypothetical protein  21.56 
 
 		 953 aa  62.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>