126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0069 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  100 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  97.16 
 
 		 282 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  38.38 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  34.13 
 
 		 282 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  35.87 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  32.61 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  35.51 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  36.23 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  35.87 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  35.51 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  33.94 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  35.14 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  34.78 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  35.14 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  36.07 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  34.42 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  34.42 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  34.42 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  31.54 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  31.25 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  33.33 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  29.82 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  29.82 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  29.82 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  29.82 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  29.82 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  29.82 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  32.47 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  30.94 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  31.34 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  31.34 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  29.2 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  30.8 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  28.83 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  28.1 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  31.64 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  29.2 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  28.62 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  28.47 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  28.88 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  31.56 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  31.56 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  27.14 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  28.62 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  26.01 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  29.09 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  27.54 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  29.09 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  25.83 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  26.97 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  26.84 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  27.74 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  26.91 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  25.64 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  29.64 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  26.94 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  27.88 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  30.07 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  28.42 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  24.82 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  26.97 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  26.28 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  23.3 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  30.32 
 
 		 164 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  27.84 
 
 		 692 aa  82  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.82 
 
 		 696 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  30.37 
 
 		 646 aa  79.3  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  25.93 
 
 		 741 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  26.39 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  27.49 
 
 		 705 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  30.05 
 
 		 652 aa  65.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  25.42 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  30.53 
 
 		 661 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  22.17 
 
 		 516 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  22.47 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  25.42 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  24.86 
 
 		 643 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  24.34 
 
 		 674 aa  58.9  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  25.42 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  25.42 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  25.42 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  24.32 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  24.32 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  25.42 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  25.51 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  24.29 
 
 		 646 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  24.29 
 
 		 646 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  23.78 
 
 		 646 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  23.68 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.32 
 
 		 709 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28.33 
 
 		 625 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  23.67 
 
 		 680 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.17 
 
 		 897 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  27.36 
 
 		 710 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  27.36 
 
 		 710 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  26.89 
 
 		 901 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  26.09 
 
 		 550 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  26.09 
 
 		 891 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  26.09 
 
 		 891 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  26.09 
 
 		 891 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>