102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0900 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  100 
 
 
286 aa  593  1e-168  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  34.28 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  34.28 
 
 
282 aa  188  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  32.62 
 
 
276 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  34.4 
 
 
276 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  33.92 
 
 
282 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  34.4 
 
 
278 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  32.62 
 
 
278 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  32.62 
 
 
278 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  31.1 
 
 
280 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  33.33 
 
 
284 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  32.62 
 
 
278 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  32.62 
 
 
278 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  32.62 
 
 
278 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  32.62 
 
 
278 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  31.91 
 
 
277 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  33.22 
 
 
283 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  32.16 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  30.58 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  31.18 
 
 
313 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  31.91 
 
 
287 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  29.33 
 
 
285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  31.56 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  30.96 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  29.58 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  30.96 
 
 
284 aa  162  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  32.14 
 
 
282 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  31.45 
 
 
282 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  30.85 
 
 
285 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  31.1 
 
 
282 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  31.45 
 
 
282 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  31.45 
 
 
282 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  31.45 
 
 
282 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  31.45 
 
 
282 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  31.45 
 
 
282 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  30.74 
 
 
282 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  30.74 
 
 
282 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  31.32 
 
 
282 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  31.1 
 
 
282 aa  155  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  30.82 
 
 
276 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  29.43 
 
 
279 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  29.33 
 
 
283 aa  153  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  27.92 
 
 
282 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  30.63 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  30.66 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  29.82 
 
 
276 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  28.37 
 
 
276 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  29.37 
 
 
281 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  27.66 
 
 
279 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  30.63 
 
 
279 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  31.1 
 
 
285 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  27.34 
 
 
282 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  28.82 
 
 
292 aa  132  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  27.14 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  28.52 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  27.14 
 
 
282 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  28.37 
 
 
274 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  26.79 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  26.86 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  37.42 
 
 
164 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  27.24 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  27.24 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  28.67 
 
 
281 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  23.45 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  22.92 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  27.39 
 
 
646 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  30.53 
 
 
692 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  27.75 
 
 
646 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  27.75 
 
 
646 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  27.75 
 
 
646 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  27.75 
 
 
646 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  30.77 
 
 
646 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  30.77 
 
 
643 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  30.77 
 
 
646 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  30.77 
 
 
646 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  30.77 
 
 
646 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  26.61 
 
 
741 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  34.31 
 
 
652 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  31.25 
 
 
674 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  32.38 
 
 
977 aa  52.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  26.04 
 
 
891 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  34.78 
 
 
646 aa  52.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  24.14 
 
 
891 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  24.14 
 
 
891 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  24.14 
 
 
891 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  24.14 
 
 
891 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  24.14 
 
 
891 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  24.14 
 
 
550 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  26.04 
 
 
892 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  24.14 
 
 
891 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  25 
 
 
891 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.55 
 
 
901 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  21.35 
 
 
651 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  21.35 
 
 
651 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  27.96 
 
 
680 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  26.21 
 
 
892 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  24.3 
 
 
648 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  24.18 
 
 
897 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.47 
 
 
696 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  22.41 
 
 
705 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>