121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2960 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
281 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  38.38 
 
 
275 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  33.7 
 
 
282 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  33.33 
 
 
282 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  35.71 
 
 
276 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  32.23 
 
 
282 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  32.23 
 
 
282 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  32.23 
 
 
282 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  32.23 
 
 
282 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  32.23 
 
 
282 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  32.23 
 
 
282 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  31.87 
 
 
282 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  31.87 
 
 
282 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  32.23 
 
 
282 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  31.87 
 
 
282 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  31.14 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  30.43 
 
 
285 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  29.56 
 
 
282 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  30.11 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  26.41 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  29.14 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  29.14 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  29.14 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  29.14 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  29.14 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  29.14 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  27.44 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  29.41 
 
 
311 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  27.9 
 
 
278 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  29.04 
 
 
313 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  27.74 
 
 
281 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  26.16 
 
 
279 aa  122  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  27.68 
 
 
289 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  27.44 
 
 
282 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  25.82 
 
 
276 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  27.44 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  26.74 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  28.22 
 
 
287 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  28.21 
 
 
284 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  28.62 
 
 
281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  28.32 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  28.37 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  26.74 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  25.63 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  27.18 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  25.82 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  28.4 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  28.4 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  26.91 
 
 
276 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  27.24 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  25.74 
 
 
278 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  26.18 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  26.01 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  27.17 
 
 
282 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  24.72 
 
 
279 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  28.11 
 
 
284 aa  102  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  23.74 
 
 
292 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  24.1 
 
 
289 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  35.22 
 
 
164 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  26.55 
 
 
283 aa  95.5  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  28.9 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  26.2 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  25.7 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  28.99 
 
 
741 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  24.82 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  28.92 
 
 
705 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  30.13 
 
 
661 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.58 
 
 
696 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  29.73 
 
 
651 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  29.73 
 
 
651 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  28.44 
 
 
692 aa  66.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  24.51 
 
 
517 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  33.08 
 
 
652 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.85 
 
 
977 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  23.27 
 
 
655 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  24.65 
 
 
516 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.37 
 
 
646 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.26 
 
 
901 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  24.49 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  26.23 
 
 
646 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  26.23 
 
 
646 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  26.23 
 
 
646 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.22 
 
 
625 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  35.82 
 
 
674 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  25 
 
 
680 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  30.56 
 
 
637 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  30.56 
 
 
637 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  26.23 
 
 
646 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  26.23 
 
 
643 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  30.56 
 
 
637 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  30.56 
 
 
637 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  30.56 
 
 
637 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  26.23 
 
 
646 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  26.35 
 
 
516 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  26.23 
 
 
646 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  26.23 
 
 
646 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  26.23 
 
 
646 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  29.17 
 
 
636 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  34.85 
 
 
701 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.78 
 
 
636 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>