80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0746 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
289 aa  599  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  79.79 
 
 
281 aa  471  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  46.38 
 
 
276 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  40.7 
 
 
280 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  40.66 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  41.39 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  39.93 
 
 
287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  40.94 
 
 
281 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  40.43 
 
 
282 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  40.66 
 
 
277 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  40.07 
 
 
282 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  40.29 
 
 
284 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  35.53 
 
 
278 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  35.53 
 
 
278 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  35.16 
 
 
278 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  35.16 
 
 
278 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  35.16 
 
 
278 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  35.16 
 
 
278 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  35.48 
 
 
283 aa  200  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  36.16 
 
 
311 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  32.61 
 
 
276 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  36.16 
 
 
313 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  32.97 
 
 
278 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  36.26 
 
 
279 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  32.73 
 
 
284 aa  185  7e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  34.07 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  33.21 
 
 
278 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  33.57 
 
 
279 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  32.6 
 
 
279 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  35.45 
 
 
276 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  34.78 
 
 
289 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  33.33 
 
 
282 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  33.96 
 
 
276 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  33.57 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  31.9 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  31.52 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  29.86 
 
 
282 aa  162  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  30.53 
 
 
279 aa  149  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  30.63 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  30.25 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  27.01 
 
 
282 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  27.01 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  26.64 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  27.01 
 
 
282 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  27.01 
 
 
282 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  27.01 
 
 
282 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  27.27 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  26.64 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  26.64 
 
 
282 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  26.64 
 
 
282 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  26.64 
 
 
282 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  26.01 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  26.64 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  28.98 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  26.01 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  29.37 
 
 
274 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  29.14 
 
 
285 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  37.5 
 
 
164 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  27.68 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  27.94 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  25.83 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  28.9 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  28.9 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  27.7 
 
 
279 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  24.4 
 
 
304 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  23.53 
 
 
741 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.33 
 
 
696 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  32.61 
 
 
892 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  29.35 
 
 
891 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  29.35 
 
 
891 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  29.35 
 
 
892 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  28.26 
 
 
891 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  28.26 
 
 
891 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  28.26 
 
 
891 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  28.26 
 
 
891 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  28.26 
 
 
897 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  28.26 
 
 
550 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  28.26 
 
 
891 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  28.26 
 
 
891 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  35.09 
 
 
674 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>