More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_4882 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  97.64 
 
 
891 aa  1784    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  97.31 
 
 
891 aa  1779    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  98.88 
 
 
891 aa  1826    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5313  BigG family transcription antiterminator  98.31 
 
 
358 aa  731    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  97.83 
 
 
550 aa  1086    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  88.78 
 
 
897 aa  1637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  99.78 
 
 
891 aa  1841    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  100 
 
 
891 aa  1843    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  99.66 
 
 
891 aa  1838    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  39.04 
 
 
901 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  99.78 
 
 
891 aa  1841    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  47.31 
 
 
892 aa  822    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  96.19 
 
 
892 aa  1749    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  99.89 
 
 
891 aa  1842    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  38.94 
 
 
977 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4597  sigma-54 factor, interaction domain-containing protein  31.09 
 
 
906 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.956591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0131  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  29.61 
 
 
915 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4788  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  28.96 
 
 
921 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.566133  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4889  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  28.43 
 
 
921 aa  310  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27762  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0683  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  27.88 
 
 
880 aa  310  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4948  sigma-54 interaction domain-containing protein  28.43 
 
 
921 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725422  normal  0.337098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0624  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  27.75 
 
 
909 aa  304  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771481  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3278  sigma-54 dependent transcription regulator  27.61 
 
 
932 aa  300  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4103  sigma-54 dependent transcription regulator  27.32 
 
 
932 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3998  sigma-54 dependent transcription regulator  27.32 
 
 
932 aa  295  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4052  sigma-54 dependent transcription regulator  27.32 
 
 
932 aa  294  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0716366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3980  sigma-54 dependent transcription regulator  27.25 
 
 
932 aa  293  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436261  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2191  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  43.14 
 
 
437 aa  289  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3954  PTS system transcriptional activator  42.72 
 
 
869 aa  233  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0961  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.44 
 
 
454 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0219  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.74 
 
 
605 aa  111  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.355755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0041  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.5 
 
 
445 aa  111  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.161462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2117  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.86 
 
 
459 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  31.47 
 
 
495 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2333  arginine utilization regulatory protein RocR  34.21 
 
 
461 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2144  arginine utilization regulatory protein RocR  34.21 
 
 
461 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.757971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3043  arginine utilization regulatory protein RocR  32.56 
 
 
477 aa  110  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.585344  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2082  arginine utilization regulatory protein  34.21 
 
 
461 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2407  arginine utilization regulatory protein RocR  34.21 
 
 
459 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.830853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2078  arginine utilization regulatory protein  34.21 
 
 
461 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2299  arginine utilization regulatory protein RocR  34.21 
 
 
461 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2280  arginine utilization regulatory protein RocR  32.56 
 
 
459 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1687  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.4 
 
 
461 aa  109  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2324  arginine utilization regulatory protein RocR  34.21 
 
 
459 aa  110  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  33.2 
 
 
472 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3620  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.44 
 
 
449 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351229  hitchhiker  0.00000838354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2114  Fis family transcriptional regulator  36.97 
 
 
573 aa  108  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0674  two-component response regulator CbrB  32.02 
 
 
453 aa  108  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0916838  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2020  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.72 
 
 
466 aa  107  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
464 aa  108  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2922  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.84 
 
 
491 aa  107  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3117  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.12 
 
 
555 aa  107  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1017  helix-turn-helix, Fis-type  35.51 
 
 
679 aa  107  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30810  sigma54-dependent activator protein  34.6 
 
 
564 aa  107  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4003  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.29 
 
 
451 aa  107  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0074  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.63 
 
 
483 aa  107  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0181228  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0476  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.29 
 
 
451 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0659  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.65 
 
 
458 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2429  NifA subfamily transcriptional regulator  30.53 
 
 
522 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0629809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0373  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36 
 
 
445 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0306  putative sigma54 specific transcriptional regulator  31.01 
 
 
455 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.11 
 
 
459 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1750  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.43 
 
 
466 aa  106  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1788  sigma-54 factor, interaction region  36.97 
 
 
542 aa  106  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.337598  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1348  putative PAS/PAC sensor protein  29.45 
 
 
506 aa  106  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0557  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 
617 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2456  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  30.53 
 
 
525 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0352047  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3839  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.38 
 
 
546 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.719613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0407  arginine utilization regulatory protein  33.6 
 
 
467 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00327881  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3833  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.61 
 
 
450 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.859471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2552  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  30.53 
 
 
525 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1698  helix-turn-helix, Fis-type  36.67 
 
 
540 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1997  sigma-54 specific Fis family two component transcriptional regulator  35.45 
 
 
452 aa  105  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3104  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.92 
 
 
448 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1401  NifA subfamily transcriptional regulator  30.53 
 
 
562 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3767  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.64 
 
 
468 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114638  normal  0.0523944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0964  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  30.59 
 
 
478 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3878  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.64 
 
 
468 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.330744  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0596  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.33 
 
 
617 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2116  Fis family transcriptional regulator  37.38 
 
 
579 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0110  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  35.68 
 
 
536 aa  105  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1901  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.03 
 
 
473 aa  105  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0172472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2087  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.72 
 
 
451 aa  105  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3798  helix-turn-helix, Fis-type  33.49 
 
 
558 aa  105  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.852136  hitchhiker  0.00299193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0093  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  35.68 
 
 
540 aa  105  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1161  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.04 
 
 
496 aa  105  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.175427  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0335  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.68 
 
 
445 aa  105  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  33.04 
 
 
458 aa  104  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0409  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.19 
 
 
467 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3295  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.22 
 
 
452 aa  104  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1152  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.47 
 
 
488 aa  104  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0888361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2741  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.2 
 
 
471 aa  104  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5671  helix-turn-helix, Fis-type  35.61 
 
 
564 aa  104  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4696  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.88 
 
 
480 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511164  decreased coverage  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_003296  RS02226  sigma-54 interacting response regulator transcription regulator protein  34.25 
 
 
491 aa  104  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0925  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.32 
 
 
500 aa  104  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4223  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.88 
 
 
449 aa  104  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168006  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.99 
 
 
480 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.601271  hitchhiker  0.000975449 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0489  arginine utilization regulatory protein RocR  32.81 
 
 
467 aa  104  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25940  sigma54-dependent activator protein  30.71 
 
 
505 aa  104  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.935166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>