108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0910 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 		 285 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  80.57 
 
 		 285 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  60 
 
 		 282 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  59.64 
 
 		 282 aa  364  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  59.64 
 
 		 282 aa  363  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  59.29 
 
 		 282 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  59.29 
 
 		 282 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  59.64 
 
 		 282 aa  362  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  59.29 
 
 		 282 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  58.93 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  59.29 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  58.93 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  59.64 
 
 		 282 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  40.22 
 
 		 285 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  40.07 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  41.64 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  36.43 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  36.07 
 
 		 282 aa  195  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  36.33 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  34.3 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  35.41 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  35.41 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  32.62 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  32.74 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  32.27 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  33.09 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  33.45 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  30.39 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  30.39 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  35.13 
 
 		 282 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  31.25 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  32.72 
 
 		 284 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  33.21 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  34.77 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  30.37 
 
 		 279 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  30.18 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  31.1 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  29.89 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  29.35 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  29.35 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  29.35 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  29.35 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  29.35 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  29.35 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  29.15 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  31.54 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  30.07 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  31.75 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  29.08 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  30.55 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  31.25 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  29.5 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  30.66 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  30.63 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  29.39 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  29.14 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  29.09 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  26.52 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  35.56 
 
 		 274 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  28.1 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  29.96 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  28.72 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  24.82 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  34.19 
 
 		 164 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  27.74 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  33.33 
 
 		 661 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.17 
 
 		 696 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  35.9 
 
 		 692 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  24.64 
 
 		 652 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  30.58 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  27.66 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  30.58 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  26.82 
 
 		 651 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  27.73 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  26.82 
 
 		 651 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  27.73 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  30.58 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  30.58 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  30.58 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  30.58 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  30.58 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  38.82 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  38.82 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  22.91 
 
 		 741 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  30.69 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.17 
 
 		 646 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  31.96 
 
 		 680 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  33.04 
 
 		 628 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  33.78 
 
 		 977 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  23.29 
 
 		 705 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.73 
 
 		 625 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  32 
 
 		 674 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  20 
 
 		 901 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.36 
 
 		 636 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  24.35 
 
 		 638 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  23.01 
 
 		 516 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.64 
 
 		 641 aa  45.8  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  21.51 
 
 		 897 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  21.3 
 
 		 681 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  25 
 
 		 623 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>