144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0916 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  80.97 
 
 		 636 aa  1059    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  65.52 
 
 		 641 aa  873    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  65.25 
 
 		 638 aa  876    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  78.65 
 
 		 637 aa  1040    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  78.49 
 
 		 637 aa  1039    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  100 
 
 		 636 aa  1313    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  78.49 
 
 		 637 aa  1038    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  78.49 
 
 		 637 aa  1040    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  78.65 
 
 		 637 aa  1041    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  42.05 
 
 		 656 aa  552  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  25.53 
 
 		 643 aa  212  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  26.25 
 
 		 646 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  25.91 
 
 		 646 aa  208  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  25.57 
 
 		 646 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  25.04 
 
 		 646 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  25.24 
 
 		 646 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  25.08 
 
 		 646 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  24.8 
 
 		 646 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  25.08 
 
 		 646 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  25.08 
 
 		 646 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  23.85 
 
 		 652 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.97 
 
 		 661 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.12 
 
 		 627 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.52 
 
 		 628 aa  150  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  22.19 
 
 		 663 aa  150  9e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  22.22 
 
 		 648 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.37 
 
 		 625 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.95 
 
 		 646 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  24.01 
 
 		 705 aa  135  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  24.95 
 
 		 612 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  25.11 
 
 		 701 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  21.75 
 
 		 655 aa  123  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  21.52 
 
 		 651 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  21.52 
 
 		 651 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.54 
 
 		 696 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  22.75 
 
 		 741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  23.33 
 
 		 516 aa  117  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.66 
 
 		 709 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  21.71 
 
 		 692 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  23.85 
 
 		 681 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  21.05 
 
 		 624 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  21.05 
 
 		 624 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.8 
 
 		 714 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  23.11 
 
 		 516 aa  111  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.91 
 
 		 705 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  24.17 
 
 		 701 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  24.77 
 
 		 674 aa  98.2  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  22.38 
 
 		 710 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  22.38 
 
 		 710 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  22.17 
 
 		 517 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  23.23 
 
 		 685 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  21.38 
 
 		 680 aa  81.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  20.4 
 
 		 685 aa  80.9  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  22 
 
 		 698 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  22 
 
 		 698 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  19.17 
 
 		 623 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0655  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  20.1 
 
 		 645 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  20 
 
 		 698 aa  71.6  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.33 
 
 		 703 aa  70.9  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  18.97 
 
 		 496 aa  70.1  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  19.51 
 
 		 670 aa  69.3  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  21.27 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  21.83 
 
 		 668 aa  65.1  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.53 
 
 		 683 aa  62.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  22.64 
 
 		 639 aa  62  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.88 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  20.56 
 
 		 559 aa  60.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  20.04 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3108  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  27.78 
 
 		 846 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.899146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2743  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  27.78 
 
 		 846 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1924  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  31.75 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.140611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  19.88 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  18.42 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1652  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  30.95 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0538047  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4087  transcriptional antiterminator, BglG  22.46 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2861  multiphosphoryl transfer protein  33.33 
 
 		 844 aa  57  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03782  predicted regulator  22.46 
 
 		 582 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03731  hypothetical protein  22.46 
 
 		 582 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4120  putative frv operon regulatory protein  22.46 
 
 		 582 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  27.81 
 
 		 684 aa  54.7  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2426  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  32.46 
 
 		 379 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4222  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  35.62 
 
 		 147 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.512284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.23 
 
 		 696 aa  53.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4712  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  28.28 
 
 		 825 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.846513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4252  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  29.85 
 
 		 863 aa  50.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2190  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  30 
 
 		 144 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2228  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  30 
 
 		 144 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3443  transcriptional antiterminator, BglG  21.74 
 
 		 481 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0052  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  30.77 
 
 		 635 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4427  putative frv operon regulatory protein  22.88 
 
 		 582 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2329  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  31.58 
 
 		 377 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4125  putative frv operon regulatory protein  22.37 
 
 		 584 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3230  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  38.46 
 
 		 377 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7071  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  30.39 
 
 		 164 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  28.12 
 
 		 977 aa  49.7  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5348  putative frv operon regulatory protein  22.15 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0411  pts system, fructose-specific iiabc component  30.49 
 
 		 625 aa  49.3  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12190  fructose-specific multiphosphoryl transfer protein  31.48 
 
 		 957 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  32.47 
 
 		 282 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0090  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  30.77 
 
 		 378 aa  48.5  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>