68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1890 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
276 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  69.93 
 
 
276 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  39.19 
 
 
278 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  38.55 
 
 
279 aa  205  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  35.51 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  35.51 
 
 
282 aa  198  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  31.14 
 
 
311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  34.91 
 
 
280 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  31.14 
 
 
313 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  34.94 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  34.67 
 
 
278 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  34.43 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  32.01 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  35.19 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  34.81 
 
 
287 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  35.45 
 
 
289 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  33.7 
 
 
276 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  33.33 
 
 
278 aa  175  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  33.33 
 
 
278 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  33.33 
 
 
278 aa  175  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  33.33 
 
 
278 aa  175  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  33.7 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  32.96 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  32.96 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  32.59 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  31.29 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  34.33 
 
 
281 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  32.22 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  31.73 
 
 
276 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  31.14 
 
 
281 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  30.66 
 
 
282 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  29.93 
 
 
275 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  29.24 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  30.26 
 
 
283 aa  153  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  29.82 
 
 
286 aa  145  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  31.02 
 
 
279 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  32.12 
 
 
285 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  27.37 
 
 
284 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  32.73 
 
 
289 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  29.96 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  28.99 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  29.93 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  29.93 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  29.2 
 
 
282 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  29.96 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  29.56 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  25.83 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  29.56 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  29.56 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  29.56 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  29.56 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  29.2 
 
 
282 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  29.2 
 
 
282 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  25.09 
 
 
282 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  31.18 
 
 
285 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  29.78 
 
 
274 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  25.82 
 
 
281 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  25.83 
 
 
282 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  30.66 
 
 
285 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  36.84 
 
 
164 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  26.67 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  24.42 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  24.42 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  25.18 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  24.47 
 
 
304 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.49 
 
 
661 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  19.81 
 
 
651 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  19.81 
 
 
651 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>