101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0759 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  63.74 
 
 
276 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  60.65 
 
 
278 aa  362  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  46.52 
 
 
287 aa  275  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  46.15 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  47.99 
 
 
284 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  47.62 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  43.17 
 
 
277 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  43.64 
 
 
276 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  40.58 
 
 
280 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  42.39 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  39.27 
 
 
278 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  39.27 
 
 
278 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  39.27 
 
 
278 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  39.27 
 
 
278 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  39.27 
 
 
278 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  39.27 
 
 
278 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  41.3 
 
 
282 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  41.37 
 
 
281 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  38.32 
 
 
313 aa  201  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  37.96 
 
 
311 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  37.32 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  34.43 
 
 
281 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  35.04 
 
 
279 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  35.66 
 
 
275 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  38.04 
 
 
285 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  35.13 
 
 
283 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  36.6 
 
 
279 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  34.07 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  36.98 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  33.7 
 
 
284 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  36.69 
 
 
279 aa  181  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  34.43 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  34.4 
 
 
286 aa  178  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  34.06 
 
 
276 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  32.73 
 
 
289 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  34.07 
 
 
276 aa  175  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  35.16 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  31.39 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  30.4 
 
 
282 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  30.4 
 
 
282 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  30.4 
 
 
282 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  30.77 
 
 
282 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  30.04 
 
 
282 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  30.04 
 
 
282 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  30.04 
 
 
282 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  30.4 
 
 
282 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  30.4 
 
 
282 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  30.4 
 
 
282 aa  155  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  30.4 
 
 
282 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  32.13 
 
 
292 aa  149  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  30 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  30.11 
 
 
279 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  28.31 
 
 
285 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  41.82 
 
 
164 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  30.18 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  32.72 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  27.88 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  27.88 
 
 
282 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  28.03 
 
 
283 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  28.03 
 
 
283 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  28.84 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  26.74 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  25.62 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  25.17 
 
 
304 aa  79  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.09 
 
 
897 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  34.09 
 
 
891 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  34.09 
 
 
892 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  32.95 
 
 
891 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  32.95 
 
 
891 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  32.95 
 
 
550 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  31.82 
 
 
891 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  31.82 
 
 
891 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  31.82 
 
 
891 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  31.82 
 
 
891 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  31.82 
 
 
891 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  34.02 
 
 
892 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  33.33 
 
 
692 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  31.63 
 
 
741 aa  52.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28 
 
 
646 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25 
 
 
661 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  24.76 
 
 
652 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.95 
 
 
696 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.72 
 
 
977 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  24.57 
 
 
705 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  33.61 
 
 
655 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  34.78 
 
 
674 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  29.11 
 
 
680 aa  43.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  28.09 
 
 
643 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  28.09 
 
 
646 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  28.09 
 
 
646 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  28.09 
 
 
646 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  30.43 
 
 
646 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  28.09 
 
 
646 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  28.09 
 
 
646 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  28.09 
 
 
646 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  28.09 
 
 
646 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  30.21 
 
 
646 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.08 
 
 
705 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  22.99 
 
 
648 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>