More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4997 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  47.32 
 
 		 892 aa  810    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  96.64 
 
 		 891 aa  1759    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5313  BigG family transcription antiterminator  96.63 
 
 		 358 aa  717    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  95.32 
 
 		 550 aa  1060    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  96.19 
 
 		 891 aa  1751    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  96.19 
 
 		 891 aa  1749    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  96.3 
 
 		 891 aa  1754    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  96.3 
 
 		 891 aa  1752    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  87.78 
 
 		 897 aa  1620    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  96.75 
 
 		 891 aa  1764    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  96.19 
 
 		 891 aa  1751    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  100 
 
 		 892 aa  1844    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  38.78 
 
 		 901 aa  646    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  96.3 
 
 		 891 aa  1752    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  38.91 
 
 		 977 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4597  sigma-54 factor, interaction domain-containing protein  30.41 
 
 		 906 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.956591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0131  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  29.42 
 
 		 915 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4788  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  28.59 
 
 		 921 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.566133  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0683  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  27.65 
 
 		 880 aa  303  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3278  sigma-54 dependent transcription regulator  27.28 
 
 		 932 aa  299  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0624  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  27.6 
 
 		 909 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2191  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  42.86 
 
 		 437 aa  293  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4103  sigma-54 dependent transcription regulator  26.97 
 
 		 932 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4052  sigma-54 dependent transcription regulator  27.06 
 
 		 932 aa  290  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0716366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3998  sigma-54 dependent transcription regulator  26.82 
 
 		 932 aa  290  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3980  sigma-54 dependent transcription regulator  26.97 
 
 		 932 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4889  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.83 
 
 		 921 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4948  sigma-54 interaction domain-containing protein  41.83 
 
 		 921 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725422  normal  0.337098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3954  PTS system transcriptional activator  41.69 
 
 		 869 aa  232  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0219  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.15 
 
 		 605 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.355755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0961  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 454 aa  111  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3620  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.48 
 
 		 449 aa  111  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351229  hitchhiker  0.00000838354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  32.95 
 
 		 472 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2922  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.84 
 
 		 491 aa  107  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.58 
 
 		 459 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0476  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.02 
 
 		 451 aa  107  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1940  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  35.43 
 
 		 455 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0074  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 483 aa  107  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0181228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1028  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.1 
 
 		 642 aa  107  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  34.98 
 
 		 495 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4003  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.02 
 
 		 451 aa  107  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0557  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.72 
 
 		 617 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0964  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  29.89 
 
 		 478 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1017  helix-turn-helix, Fis-type  33.45 
 
 		 679 aa  106  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0925  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 500 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3117  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.12 
 
 		 555 aa  106  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 464 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0306  putative sigma54 specific transcriptional regulator  31.01 
 
 		 455 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4419  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 448 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3833  putative sigma54 specific transcriptional regulator  34.02 
 
 		 450 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.859471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0041  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 445 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0373  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.07 
 
 		 445 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0674  two-component response regulator CbrB  32.02 
 
 		 453 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0916838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0596  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.18 
 
 		 617 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2741  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.6 
 
 		 471 aa  105  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2117  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.05 
 
 		 459 aa  105  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0409  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.6 
 
 		 467 aa  105  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1788  sigma-54 factor, interaction region  36.49 
 
 		 542 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.337598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1613  Sigma 54 interacting domain protein  33.33 
 
 		 532 aa  105  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3043  arginine utilization regulatory protein RocR  31.91 
 
 		 477 aa  105  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.585344  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2144  arginine utilization regulatory protein RocR  32.16 
 
 		 461 aa  105  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.757971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2082  arginine utilization regulatory protein  32.16 
 
 		 461 aa  105  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2280  arginine utilization regulatory protein RocR  31.91 
 
 		 459 aa  105  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2382  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 454 aa  105  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.598165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2299  arginine utilization regulatory protein RocR  32.16 
 
 		 461 aa  105  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2324  arginine utilization regulatory protein RocR  32.16 
 
 		 459 aa  105  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2333  arginine utilization regulatory protein RocR  33.33 
 
 		 461 aa  104  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2407  arginine utilization regulatory protein RocR  33.33 
 
 		 459 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.830853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1997  sigma-54 specific Fis family two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 452 aa  104  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2114  Fis family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 573 aa  104  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2078  arginine utilization regulatory protein  33.33 
 
 		 461 aa  104  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0352  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.62 
 
 		 554 aa  104  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0365  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.62 
 
 		 554 aa  104  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1698  helix-turn-helix, Fis-type  36.19 
 
 		 540 aa  104  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1687  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.49 
 
 		 461 aa  104  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1901  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 473 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2020  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.26 
 
 		 466 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30810  sigma54-dependent activator protein  34.12 
 
 		 564 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0407  arginine utilization regulatory protein  36.89 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00327881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0403  arginine utilization regulatory protein  36.41 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4715  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 466 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.112239  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.12 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4696  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.27 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511164  decreased coverage  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.601271  hitchhiker  0.000975449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0545  arginine utilization regulatory protein RocR  36.41 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.660554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0464  arginine utilization regulatory protein RocR  36.41 
 
 		 467 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0987  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.03 
 
 		 489 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3590  helix-turn-helix, Fis-type  29.33 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2099  Fis family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 574 aa  103  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1152  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.03 
 
 		 488 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0888361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0489  arginine utilization regulatory protein RocR  36.41 
 
 		 467 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1750  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.53 
 
 		 466 aa  103  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3104  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 448 aa  103  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1254  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.388952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0659  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.72 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1348  putative PAS/PAC sensor protein  28.8 
 
 		 506 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2171  putative sensory box sigma-54 dependent transcriptional regulator  31.6 
 
 		 469 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 454 aa  102  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4223  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.48 
 
 		 449 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2116  Fis family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 579 aa  102  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>