More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4597 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4597  sigma-54 factor, interaction domain-containing protein  100 
 
 
906 aa  1859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.956591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  32.44 
 
 
901 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.79 
 
 
977 aa  412  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  30.62 
 
 
891 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  30.62 
 
 
891 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  30.62 
 
 
891 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  30.62 
 
 
891 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  30.62 
 
 
891 aa  399  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31.26 
 
 
897 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  30.41 
 
 
891 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  30.13 
 
 
892 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  30.09 
 
 
891 aa  392  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  29.87 
 
 
891 aa  392  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  28.82 
 
 
892 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0131  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  30.57 
 
 
915 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4788  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  28.26 
 
 
921 aa  322  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.566133  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4889  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  28.26 
 
 
921 aa  320  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27762  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3278  sigma-54 dependent transcription regulator  27.45 
 
 
932 aa  318  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3980  sigma-54 dependent transcription regulator  27.53 
 
 
932 aa  318  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436261  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4948  sigma-54 interaction domain-containing protein  28.26 
 
 
921 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725422  normal  0.337098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4103  sigma-54 dependent transcription regulator  27.58 
 
 
932 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3998  sigma-54 dependent transcription regulator  27.63 
 
 
932 aa  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4052  sigma-54 dependent transcription regulator  27.58 
 
 
932 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0716366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0683  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  25.76 
 
 
880 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0624  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  25.6 
 
 
909 aa  297  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771481  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2191  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  45.3 
 
 
437 aa  297  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5313  BigG family transcription antiterminator  45.57 
 
 
358 aa  290  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3954  PTS system transcriptional activator  37.75 
 
 
869 aa  250  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  23.56 
 
 
550 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0041  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.71 
 
 
445 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.161462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003533  putative LuxO repressor protein  36.24 
 
 
503 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1166  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.16 
 
 
675 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.321857  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3997  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family protein  33.62 
 
 
455 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3800  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 
488 aa  108  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2510  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31.45 
 
 
448 aa  108  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02228  hypothetical protein  34.4 
 
 
513 aa  107  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1443  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.12 
 
 
456 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2937  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.12 
 
 
457 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.37 
 
 
447 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2402  transcriptional regulator, Fis family  29.71 
 
 
641 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1417  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.12 
 
 
457 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  31.94 
 
 
454 aa  106  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0941  transcriptional regulator AcoR  28.79 
 
 
625 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0702  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 
460 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001942  putative sigma-54 interacting response regulator transcription regulator protein  34.91 
 
 
447 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1407  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.33 
 
 
456 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2742  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.3 
 
 
469 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2849  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.3 
 
 
469 aa  105  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2674  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.3 
 
 
469 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.26 
 
 
495 aa  105  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0534594  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1874  two component signal response regulator LuxO  29.92 
 
 
469 aa  105  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0317984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10290  transcriptional regulator AcoR  28.4 
 
 
625 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153743  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3647  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.6 
 
 
451 aa  104  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0373  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.76 
 
 
445 aa  104  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3709  sigma-54 factor, interaction region  29.41 
 
 
457 aa  104  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4753  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  31.82 
 
 
557 aa  104  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.050677  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3541  response regulator receiver protein  29.32 
 
 
1009 aa  104  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1010  NifA subfamily transcriptional regulator  32.11 
 
 
510 aa  104  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0963  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.64 
 
 
467 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1337  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.2 
 
 
679 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2020  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.26 
 
 
466 aa  104  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0889  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.82 
 
 
457 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.562969  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0282  transcriptional regulator NifA  27.98 
 
 
525 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.262632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3572  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.23 
 
 
457 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0596  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.11 
 
 
617 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0557  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.26 
 
 
617 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4808  two-component response regulator CbrB  31.23 
 
 
478 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069592  hitchhiker  0.0095877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1152  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.67 
 
 
488 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0888361  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0335  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 
445 aa  103  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6393  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.71 
 
 
455 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1981  two-component response regulator, sigma-54 related  27.83 
 
 
448 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472322  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5645  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.71 
 
 
455 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1428  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.78 
 
 
460 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3245  sigma 54-dependent DNA-binding response regulator  33.94 
 
 
488 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6170  helix-turn-helix, Fis-type  28.26 
 
 
677 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0094108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2554  type 4 fimbriae expression regulatory protein PilR  32.87 
 
 
452 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0975  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.1 
 
 
457 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0054  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.53 
 
 
525 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0172  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.86 
 
 
458 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833234  hitchhiker  0.00415361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1378  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.71 
 
 
455 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713038  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6451  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.71 
 
 
455 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5447  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.71 
 
 
455 aa  102  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.94 
 
 
446 aa  102  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3620  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.71 
 
 
449 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351229  hitchhiker  0.00000838354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0312  Sigma 54 interacting domain protein  29.93 
 
 
934 aa  101  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2101  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.41 
 
 
478 aa  101  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6043  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.71 
 
 
455 aa  101  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174163  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3475  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  32.77 
 
 
529 aa  101  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.232815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1491  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.48 
 
 
449 aa  101  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.174924  hitchhiker  0.0000639824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0602  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.8 
 
 
617 aa  101  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690484 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1750  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.92 
 
 
466 aa  101  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1034  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.64 
 
 
449 aa  101  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41690  Sigma54-dependent transcriptional activator protein, AcoR  32.26 
 
 
613 aa  101  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2061  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.63 
 
 
442 aa  101  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1533  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.72 
 
 
449 aa  100  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.104993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.74 
 
 
511 aa  100  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0674  two-component response regulator CbrB  32.72 
 
 
453 aa  100  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0916838  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1901  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.17 
 
 
473 aa  100  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0172472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3581  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.06 
 
 
490 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1815  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.68 
 
 
433 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>