More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2191 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2191  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  100 
 
 
437 aa  879    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  43.02 
 
 
977 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  44.52 
 
 
901 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  45.09 
 
 
897 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0131  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  39.2 
 
 
915 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4597  sigma-54 factor, interaction domain-containing protein  45.3 
 
 
906 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.956591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  42.68 
 
 
892 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  42.96 
 
 
891 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  42.96 
 
 
891 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  42.96 
 
 
891 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  42.96 
 
 
891 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  42.29 
 
 
891 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  42.29 
 
 
891 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  43.28 
 
 
891 aa  285  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  42.71 
 
 
891 aa  285  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5313  BigG family transcription antiterminator  45.27 
 
 
358 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  38.84 
 
 
892 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3278  sigma-54 dependent transcription regulator  39.27 
 
 
932 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4103  sigma-54 dependent transcription regulator  41.59 
 
 
932 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4052  sigma-54 dependent transcription regulator  41.59 
 
 
932 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0716366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3998  sigma-54 dependent transcription regulator  41.59 
 
 
932 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3980  sigma-54 dependent transcription regulator  41.59 
 
 
932 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0683  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  41.12 
 
 
880 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0624  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  42.36 
 
 
909 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771481  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4889  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.48 
 
 
921 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27762  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4948  sigma-54 interaction domain-containing protein  36.48 
 
 
921 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725422  normal  0.337098 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4788  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.22 
 
 
921 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.566133  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3954  PTS system transcriptional activator  40.75 
 
 
869 aa  226  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3620  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.15 
 
 
449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351229  hitchhiker  0.00000838354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2025  response regulator receiver protein  35.27 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.423552  hitchhiker  0.000000362421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0164  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.82 
 
 
450 aa  113  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.342124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0041  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.161462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0146  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.82 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.742059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1895  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.59 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.818173  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2653  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.47 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1417  two component Fis family transcriptional regulator  31.93 
 
 
492 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  31.41 
 
 
472 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1378  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.63 
 
 
455 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1643  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.63 
 
 
444 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6451  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.63 
 
 
455 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2510  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31.15 
 
 
448 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0904  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.03 
 
 
479 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.86 
 
 
755 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1528  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.16 
 
 
479 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.163365  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6393  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.63 
 
 
455 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106085 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5645  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.63 
 
 
455 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2035  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.08 
 
 
655 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6043  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.19 
 
 
455 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174163  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0467  transcriptional regulator, Fis family  33.8 
 
 
767 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5447  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.19 
 
 
455 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2923  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.06 
 
 
450 aa  107  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6170  helix-turn-helix, Fis-type  32.92 
 
 
677 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0094108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0054  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.64 
 
 
525 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4752  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.55 
 
 
477 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.102519  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.57 
 
 
446 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447453 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0055  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.11 
 
 
756 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.928801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3581  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.54 
 
 
490 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2171  putative sensory box sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.56 
 
 
469 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1017  helix-turn-helix, Fis-type  34.58 
 
 
679 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3590  helix-turn-helix, Fis-type  31.22 
 
 
436 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0944  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.88 
 
 
480 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1894  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.93 
 
 
456 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.410758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1185  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.82 
 
 
480 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170732  normal  0.829562 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1203  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.29 
 
 
417 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.477797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1078  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  34.93 
 
 
523 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.18 
 
 
447 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2176  NifA subfamily transcriptional regulator  34.93 
 
 
531 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000386185  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1464  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.77 
 
 
1139 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2034  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  33.96 
 
 
487 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.669583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2158  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.18 
 
 
453 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2173  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.73 
 
 
490 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0373  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.8 
 
 
445 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  33.47 
 
 
684 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1901  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.33 
 
 
473 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0172472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2797  putative sigma54 specific transcriptional regulator  29.58 
 
 
512 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3376  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.13 
 
 
466 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2148  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.39 
 
 
503 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3169  formate hydrogenlyase transcriptional activator  30.52 
 
 
687 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.781229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2981  formate hydrogenlyase transcriptional activator  30.52 
 
 
692 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3064  formate hydrogenlyase transcriptional activator  30.52 
 
 
692 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0761446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3363  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.86 
 
 
763 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3048  formate hydrogenlyase transcriptional activator  30.52 
 
 
687 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1080  Sigma 54 interacting domain protein  29.96 
 
 
512 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2302  sigma-54 dependent transcriptional regulator  33.48 
 
 
449 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2115  putative sensory box sigma-54 dependent transcriptional regulator  33.48 
 
 
467 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1337  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.54 
 
 
679 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1136  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.66 
 
 
466 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2053  Fis family transcriptional regulator  29.89 
 
 
664 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.28 
 
 
494 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2402  transcriptional regulator, Fis family  29.89 
 
 
641 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4730  Sigma 54 interacting domain protein  31.92 
 
 
522 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.672961  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4272  sigma-54 dependent response regulator  27.47 
 
 
457 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1777  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.23 
 
 
465 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7013  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.56 
 
 
455 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.624192  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.05 
 
 
575 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4419  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.76 
 
 
448 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2283  sigma-54 dependent transcriptional regulator  33.03 
 
 
451 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.72 
 
 
447 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3723  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.1 
 
 
521 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.946977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1396  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.54 
 
 
441 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>