More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0683 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0683  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  100 
 
 
880 aa  1816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0624  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  99.32 
 
 
909 aa  1805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771481  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0131  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  35.31 
 
 
915 aa  586  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4788  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
921 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.566133  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4948  sigma-54 interaction domain-containing protein  33.15 
 
 
921 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725422  normal  0.337098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4889  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.15 
 
 
921 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27762  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3954  PTS system transcriptional activator  30.43 
 
 
869 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  29.94 
 
 
901 aa  349  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3278  sigma-54 dependent transcription regulator  29.85 
 
 
932 aa  334  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  30.52 
 
 
977 aa  325  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  29.78 
 
 
892 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  27.99 
 
 
891 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  27.99 
 
 
891 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  27.99 
 
 
891 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  27.99 
 
 
891 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  27.88 
 
 
891 aa  303  9e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  27.69 
 
 
891 aa  303  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  27.69 
 
 
891 aa  303  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  27.77 
 
 
891 aa  300  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4597  sigma-54 factor, interaction domain-containing protein  25.76 
 
 
906 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.956591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.38 
 
 
897 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  27.65 
 
 
892 aa  296  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2191  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  41.12 
 
 
437 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5313  BigG family transcription antiterminator  40.06 
 
 
358 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3980  sigma-54 dependent transcription regulator  39.27 
 
 
932 aa  224  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436261  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3998  sigma-54 dependent transcription regulator  39.55 
 
 
932 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4103  sigma-54 dependent transcription regulator  39.55 
 
 
932 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4052  sigma-54 dependent transcription regulator  39.55 
 
 
932 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0716366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0445  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.51 
 
 
481 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0417  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.79 
 
 
474 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.45134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0446  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.51 
 
 
481 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4152  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.79 
 
 
480 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.038607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2402  transcriptional regulator, Fis family  36.02 
 
 
641 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0074  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.93 
 
 
453 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20940  sigma54-dependent activator protein AcxR  32.86 
 
 
664 aa  113  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2072  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  29.55 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1348  putative PAS/PAC sensor protein  35.27 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0475  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.07 
 
 
453 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318452  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1495  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  34.93 
 
 
458 aa  111  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.301103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1095  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.44 
 
 
442 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3403  helix-turn-helix, Fis-type  32.78 
 
 
494 aa  111  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.77 
 
 
464 aa  111  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0670  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.4 
 
 
453 aa  111  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1028  response regulator receiver protein  37.44 
 
 
439 aa  110  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163891  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  33.73 
 
 
454 aa  110  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3541  response regulator receiver protein  33.73 
 
 
1009 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0551  two component Fis family transcriptional regulator  33.62 
 
 
476 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02302  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.74 
 
 
748 aa  110  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1080  Sigma 54 interacting domain protein  31.25 
 
 
512 aa  110  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3581  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.89 
 
 
490 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4346  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.44 
 
 
442 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.788839  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0424  Sigma 54 interacting domain protein  33.58 
 
 
533 aa  109  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4134  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.16 
 
 
503 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1847  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.98 
 
 
459 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.122843  normal  0.436579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42680  sigma54-dependent response regulator, CbrB  34.86 
 
 
466 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4227  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  30.7 
 
 
531 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0941591  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1706  sigma-54 dependent transcriptional regulator  33.59 
 
 
532 aa  108  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0836  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.55 
 
 
469 aa  108  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0464248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1319  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.47 
 
 
452 aa  108  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4390  transcriptional regulator TyrR  35.14 
 
 
502 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1287  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.81 
 
 
452 aa  108  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541874  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1117  nitrogen regulation protein NtrC  30.04 
 
 
491 aa  108  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.837071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2269  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.04 
 
 
493 aa  108  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1017  helix-turn-helix, Fis-type  34.35 
 
 
679 aa  108  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0526  sigma-54 dependent transcriptional regulator  36.49 
 
 
462 aa  108  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888522  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1567  sigma-54 factor, interaction region  34.73 
 
 
381 aa  108  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0116194  hitchhiker  0.0000311693 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1075  nitrogen regulation protein NR(I)  30.04 
 
 
491 aa  108  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00433068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1107  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.02 
 
 
442 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3623  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.47 
 
 
489 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.568637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3555  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.47 
 
 
489 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3245  Sigma 54 interacting domain protein  35.02 
 
 
512 aa  107  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.07 
 
 
459 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2958  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.81 
 
 
472 aa  107  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0997  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  31.13 
 
 
502 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1066  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.02 
 
 
442 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0831  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  34.7 
 
 
518 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5933  NifA subfamily transcriptional regulator  31.07 
 
 
580 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0344  two component Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 
452 aa  107  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0882822  normal  0.355114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2053  Fis family transcriptional regulator  32.77 
 
 
664 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0332  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.6 
 
 
469 aa  107  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.465248 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1240  transcriptional regulator NifA  32.92 
 
 
582 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0431383  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1034  transcriptional regulator, TyrR  31.13 
 
 
502 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1166  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.68 
 
 
675 aa  107  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.321857  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2653  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.71 
 
 
482 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0125  response regulator receiver protein  34.18 
 
 
460 aa  107  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.847419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1010  NifA subfamily transcriptional regulator  35.02 
 
 
510 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0198  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.16 
 
 
461 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1161  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.2 
 
 
496 aa  106  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.175427  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03965  two-component system regulatory protein  36.32 
 
 
448 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3471  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.54 
 
 
489 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0074  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.93 
 
 
483 aa  106  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0181228  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0996  putative PAS/PAC sensor protein  30.91 
 
 
502 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2554  type 4 fimbriae expression regulatory protein PilR  32.09 
 
 
452 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1101  helix-turn-helix, Fis-type  34.05 
 
 
502 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0485  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  33.8 
 
 
482 aa  105  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0514361  normal  0.01861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  35.85 
 
 
472 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.58 
 
 
582 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0889  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.74 
 
 
457 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.562969  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  29.8 
 
 
755 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5524  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.73 
 
 
640 aa  105  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.118768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>