More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1567 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1567  sigma-54 factor, interaction region  100 
 
 
381 aa  774    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0116194  hitchhiker  0.0000311693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0556  response regulator receiver protein  58.38 
 
 
367 aa  408  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7716  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.49 
 
 
366 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.416499  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43900  Sigma54-dependent transcriptional activator protein  57.82 
 
 
367 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2982  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  58.92 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165911  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2771  sigma-54 dependent transcriptional regulator  57.82 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3248  helix-turn-helix, Fis-type  54.95 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12684  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2908  putative transcriptional regulator  56.51 
 
 
376 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2162  putative sigma54 specific transcriptional regulator  56.7 
 
 
366 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332569  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5791  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.88 
 
 
375 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34150  putative transcriptional regulator  56.94 
 
 
361 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.093709  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34210  putative transcriptional regulator  56.51 
 
 
376 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0247085  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6156  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.88 
 
 
375 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164312  normal  0.688082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3467  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  54.67 
 
 
368 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3918  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  56.16 
 
 
367 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84668  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0881  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  56.58 
 
 
373 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.588109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2903  putative transcriptional regulator  56.67 
 
 
361 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3328  response regulator receiver protein  57.5 
 
 
352 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6636  putative sigma54 specific transcriptional regulator  54.32 
 
 
375 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6033  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  56.02 
 
 
376 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.516137  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5803  putative sigma54 specific transcriptional regulator  56.81 
 
 
376 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0564  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.12 
 
 
391 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2612  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51.52 
 
 
372 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3526  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.07 
 
 
377 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6136  putative sigma54 specific transcriptional regulator  52.73 
 
 
389 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0424882  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3993  putative sigma54 specific transcriptional regulator  50.96 
 
 
375 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal  0.104831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22350  sigma54-dependent activator protein  49.58 
 
 
343 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1248  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.76 
 
 
373 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.81595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1994  two component signal transduction response regulator  46.59 
 
 
477 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0850  two component Fis family transcriptional regulator  53.63 
 
 
462 aa  278  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2563  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.23 
 
 
480 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.69 
 
 
495 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.75 
 
 
486 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.64 
 
 
483 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5217  sigma-54-binding protein  46.98 
 
 
316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0961  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.64 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  53.72 
 
 
453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.27 
 
 
480 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31690  Sigma54 -dependent activator protein  52.06 
 
 
309 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.39 
 
 
476 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0399  putative PAS/PAC sensor protein  49.64 
 
 
695 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2606  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  54.55 
 
 
501 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  57.21 
 
 
875 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.44 
 
 
454 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0327  sigma-54 factor, interaction region  50.94 
 
 
316 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.768789  normal  0.257375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13000  transcriptional regulator  53.28 
 
 
324 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.597599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1003  nitrogen regulation protein NR(I)  44.25 
 
 
481 aa  271  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2274  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.14 
 
 
512 aa  272  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5223  putative sigma54 specific transcriptional regulator  53.41 
 
 
276 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6189  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2041  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  44.09 
 
 
455 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0299  putative sigma54 specific transcriptional regulator  52.09 
 
 
276 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4418  transcriptional regulatory protein ZraR  41.24 
 
 
441 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5166  sigma-54 dependent transcriptional regulator  53.21 
 
 
276 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002813  flagellar regulatory protein FleQ  41.52 
 
 
469 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0751  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.62 
 
 
485 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0880271  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0916  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.61 
 
 
480 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1772  putative sigma54 specific transcriptional regulator  44.86 
 
 
386 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1472  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.13 
 
 
451 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0643  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.07 
 
 
478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1972  response regulator receiver protein  55.42 
 
 
455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3351  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.6 
 
 
465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5073  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  53.21 
 
 
276 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1175  transcriptional regulator  53.28 
 
 
324 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1798  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  51.1 
 
 
450 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4581  transcriptional regulatory protein ZraR  47.74 
 
 
441 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4505  transcriptional regulatory protein ZraR  47.74 
 
 
441 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1405  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.27 
 
 
478 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000117702 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04971  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  54.36 
 
 
444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1926  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.21 
 
 
575 aa  269  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4385  transcriptional regulatory protein ZraR  47.74 
 
 
441 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3407  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.59 
 
 
458 aa  269  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03164  hypothetical protein  41.81 
 
 
469 aa  269  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2805  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.57 
 
 
478 aa  269  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.228775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1058  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50.97 
 
 
462 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0191246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3623  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.18 
 
 
489 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.568637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3555  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.18 
 
 
489 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5444  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  55.98 
 
 
515 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0775  helix-turn-helix, Fis-type  48.11 
 
 
457 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  52.03 
 
 
453 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4507  transcriptional regulatory protein ZraR  47.39 
 
 
441 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0570238 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0629  sigma-54 dependent transcriptional regulator  53.25 
 
 
342 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2408  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.86 
 
 
482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3471  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.82 
 
 
489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001184  putative two-component response regulator  43.66 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.7 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0776  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  52.72 
 
 
465 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.58 
 
 
448 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1810  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.57 
 
 
482 aa  265  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.94 
 
 
459 aa  265  8e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1024  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.89 
 
 
544 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000701357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0789  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.25 
 
 
448 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0143  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.77 
 
 
449 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2506  sensory box protein/sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.82 
 
 
564 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.92979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.98 
 
 
451 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0540  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.82 
 
 
445 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  50.19 
 
 
461 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2269  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.85 
 
 
456 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.89 
 
 
455 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1075  nitrogen regulation protein NR(I)  42.41 
 
 
491 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00433068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1719  flagellar regulatory protein C  52.38 
 
 
479 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0473988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>