More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2937 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2937  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  100 
 
 
457 aa  939    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1417  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  98.91 
 
 
457 aa  925    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2849  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  75.61 
 
 
469 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1407  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  96.05 
 
 
456 aa  898    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2674  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  76.12 
 
 
469 aa  712    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2742  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  75.61 
 
 
469 aa  710    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1319  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  80.96 
 
 
457 aa  759    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1443  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  98.68 
 
 
456 aa  924    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3997  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family protein  68.94 
 
 
455 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3709  sigma-54 factor, interaction region  68.83 
 
 
457 aa  627  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1491  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.4 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.174924  hitchhiker  0.0000639824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001942  putative sigma-54 interacting response regulator transcription regulator protein  55.51 
 
 
447 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3878  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.16 
 
 
468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.330744  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3767  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.16 
 
 
468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114638  normal  0.0523944 
 
 
-
 
NC_003296  RS02226  sigma-54 interacting response regulator transcription regulator protein  40.39 
 
 
491 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02227  sigma-54 interacting transcription regulator protein  46.92 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3379  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  50 
 
 
352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.270245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5077  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.83 
 
 
338 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1901  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.48 
 
 
473 aa  299  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0172472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1133  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  50.32 
 
 
352 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2148  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.58 
 
 
503 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3768  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  48.54 
 
 
365 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.251278  normal  0.151277 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3879  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  48.54 
 
 
365 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5076  helix-turn-helix, Fis-type  46.82 
 
 
467 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196464  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6393  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.04 
 
 
455 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106085 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5645  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.04 
 
 
455 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01277  putative sigma-54 interacting response regulator protein  51.77 
 
 
443 aa  293  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5447  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.79 
 
 
455 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2152  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.68 
 
 
351 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170653 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6043  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.23 
 
 
455 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174163  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7013  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.94 
 
 
455 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.624192  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1378  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.23 
 
 
455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713038  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6451  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.23 
 
 
455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1136  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.88 
 
 
466 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3376  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.74 
 
 
466 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0273  sigma-54 specific transcriptional regulator, Fis famliy  47.73 
 
 
342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.090117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4156  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.99 
 
 
443 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2268  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  45.35 
 
 
456 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071991  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1293  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  45.35 
 
 
456 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3163  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  45.35 
 
 
456 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1982  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  45.35 
 
 
456 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0730  Fis family transcriptional regulator  48.17 
 
 
388 aa  280  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1382  putative sigma-54 interacting response regulator  45.35 
 
 
456 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3034  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  45.35 
 
 
456 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1004  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  45.35 
 
 
456 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1383  putative sigma-54 interacting transcriptional regulator  43.14 
 
 
418 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2057  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.57 
 
 
448 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4752  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.77 
 
 
477 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.102519  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2280  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.11 
 
 
453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0260  response regulator receiver domain-containing protein  48.88 
 
 
443 aa  273  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.75 
 
 
468 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4246  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.2 
 
 
400 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.6 
 
 
451 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.62 
 
 
454 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2618  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.1 
 
 
453 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0673  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.5 
 
 
457 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0437  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.41 
 
 
490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3274  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.89 
 
 
467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156688  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0300  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.18 
 
 
457 aa  267  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2807  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.34 
 
 
466 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.05 
 
 
447 aa  266  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3572  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.6 
 
 
457 aa  266  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0884  NifA subfamily transcriptional regulator  44.77 
 
 
539 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0673  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.86 
 
 
458 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  45.2 
 
 
460 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2270  sigma-54 interaction domain/Fis family transcriptional regulator domain-containing protein  45.7 
 
 
322 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1984  sigma-54 dependent transcriptional regulator  45.7 
 
 
322 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622881  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3036  sigma-54 interaction domain/Fis family transcriptional regulator domain-containing protein  45.7 
 
 
322 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1006  sigma-54 interaction domain/Fis family transcriptional regulator domain-containing protein  45.7 
 
 
322 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1294  sigma-54 dependent transcriptional regulator  45.7 
 
 
322 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.891307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3269  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
467 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49020  sigma54-dependent transcriptional activator for the iron only nitrogenase, AnfA  44.26 
 
 
537 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.67 
 
 
469 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2510  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  46.05 
 
 
448 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.67 
 
 
467 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.67 
 
 
469 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1388  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.34 
 
 
463 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0597975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1527  Fis family transcriptional regulator  45.31 
 
 
537 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3165  sigma-54 interaction domain/Fis family transcriptional regulator domain-containing protein  45.36 
 
 
322 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.35 
 
 
470 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5446  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.88 
 
 
347 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5854  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.43 
 
 
466 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2158  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.45 
 
 
453 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.99 
 
 
463 aa  260  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.57 
 
 
446 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1588  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.6 
 
 
458 aa  260  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1981  two-component response regulator, sigma-54 related  45.93 
 
 
448 aa  260  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472322  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.34 
 
 
458 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2100  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.14 
 
 
466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1495  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  43.03 
 
 
458 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.301103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4344  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50.42 
 
 
547 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162521  normal  0.0144211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.14 
 
 
451 aa  259  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.667822  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3647  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.28 
 
 
451 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1919  Fis family transcriptional regulator  43.79 
 
 
545 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1379  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.88 
 
 
384 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.730232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5989  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.89 
 
 
459 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999422  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6450  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.88 
 
 
384 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.68 
 
 
495 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1228  Fis family transcriptional regulator  43.87 
 
 
549 aa  258  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.45 
 
 
481 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.481364  normal  0.940549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>