79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3469 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
285 aa  584  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  40.21 
 
 
282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  39.5 
 
 
282 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  38.43 
 
 
280 aa  221  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  39.78 
 
 
276 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  39.27 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  37.99 
 
 
311 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  38.35 
 
 
313 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  37.05 
 
 
276 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  38.04 
 
 
278 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  35.87 
 
 
287 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  37.18 
 
 
277 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  35.87 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  36.56 
 
 
279 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  35.31 
 
 
284 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  33.45 
 
 
278 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  33.45 
 
 
278 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  33.45 
 
 
278 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  33.45 
 
 
278 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  33.45 
 
 
278 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  33.45 
 
 
278 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  34.97 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  33.33 
 
 
276 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  33.57 
 
 
282 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  29.33 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  33.57 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  35.36 
 
 
283 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  33.33 
 
 
278 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  32.97 
 
 
281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  35.02 
 
 
281 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  32.61 
 
 
279 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  30.82 
 
 
279 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  34.81 
 
 
282 aa  152  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  29.24 
 
 
289 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  30.8 
 
 
276 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  32 
 
 
275 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  29.96 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  31.27 
 
 
282 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  31.27 
 
 
282 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  30.91 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  30.91 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  29.14 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  30.91 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  31.07 
 
 
282 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  31.07 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  31.07 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  31.07 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  31.07 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  27.7 
 
 
285 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  29.24 
 
 
285 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  26.86 
 
 
279 aa  129  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  29.64 
 
 
282 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  31.65 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  27.74 
 
 
282 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  29.39 
 
 
285 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  27.74 
 
 
282 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  30.58 
 
 
279 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  39.47 
 
 
164 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  29.56 
 
 
282 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  27.24 
 
 
282 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  27.24 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  29.17 
 
 
283 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  29.17 
 
 
283 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  30.28 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  25.35 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  28.97 
 
 
892 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  25.81 
 
 
891 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  25.81 
 
 
891 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  37.7 
 
 
646 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  37.7 
 
 
646 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  37.7 
 
 
646 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  37.7 
 
 
646 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  37.7 
 
 
643 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  37.7 
 
 
646 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  37.7 
 
 
646 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  37.7 
 
 
646 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  37.7 
 
 
646 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  37.7 
 
 
646 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  30.99 
 
 
692 aa  43.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>