101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2325 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  66.31 
 
 
311 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  66.19 
 
 
313 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  39.07 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  43.87 
 
 
282 aa  242  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  38.35 
 
 
282 aa  235  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  37.99 
 
 
282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  38.32 
 
 
276 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  39.49 
 
 
278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  38.32 
 
 
283 aa  208  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  37.96 
 
 
287 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  37.23 
 
 
278 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  37.59 
 
 
287 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  38.32 
 
 
276 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  35.36 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  36.13 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  38.04 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  36.5 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  35.04 
 
 
278 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  33.09 
 
 
284 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  36.26 
 
 
289 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  33.22 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  36.56 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  32.1 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  32.01 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  31.75 
 
 
278 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  31.75 
 
 
278 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  35.25 
 
 
281 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  31.39 
 
 
278 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  31.39 
 
 
278 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  31.39 
 
 
278 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  31.39 
 
 
278 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  34.43 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  31.02 
 
 
279 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  32.23 
 
 
276 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  32.97 
 
 
282 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  32.97 
 
 
282 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  32.97 
 
 
282 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  32.97 
 
 
282 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  32.97 
 
 
282 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  32.97 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  32.97 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  32.62 
 
 
282 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  32.62 
 
 
282 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  32.62 
 
 
282 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  29.58 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  29.75 
 
 
285 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  33.09 
 
 
283 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  29.71 
 
 
279 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  31.8 
 
 
282 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  31.93 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  32.74 
 
 
285 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  30.94 
 
 
282 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  30.18 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  29.58 
 
 
292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  31.88 
 
 
282 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  31.4 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  31.4 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  31.05 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  27.8 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  28.94 
 
 
282 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  27.53 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  33.77 
 
 
164 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  28.37 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  23.38 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  22.38 
 
 
652 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.5 
 
 
696 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  38.89 
 
 
977 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.22 
 
 
625 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.42 
 
 
646 aa  53.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  23.53 
 
 
646 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  29.67 
 
 
901 aa  52.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  25 
 
 
892 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  33.72 
 
 
680 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  24.61 
 
 
646 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  31.58 
 
 
648 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  24.08 
 
 
646 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  20.87 
 
 
692 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  24.48 
 
 
643 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  24.61 
 
 
646 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  24.61 
 
 
646 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  24.61 
 
 
646 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  24.61 
 
 
646 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  40.62 
 
 
674 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  23.66 
 
 
646 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  25.24 
 
 
891 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  25.27 
 
 
550 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  25.24 
 
 
891 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  25.24 
 
 
891 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  25.24 
 
 
891 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  25.24 
 
 
891 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  25.24 
 
 
891 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  24.27 
 
 
891 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  22.58 
 
 
646 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  25.24 
 
 
891 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  25.24 
 
 
892 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.61 
 
 
661 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  24.18 
 
 
897 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3633  stationary phase inducible protein CsiE  38.24 
 
 
421 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673534  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  33.7 
 
 
628 aa  42.7  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>