90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1354 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
279 aa  558  1e-158  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  57.19 
 
 
283 aa  329  3e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  40.07 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  38.35 
 
 
283 aa  212  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  38.57 
 
 
280 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  36.23 
 
 
278 aa  208  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  36.23 
 
 
278 aa  208  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  36.23 
 
 
278 aa  208  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  36.23 
 
 
278 aa  208  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  36.23 
 
 
278 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  36.23 
 
 
278 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  36.59 
 
 
277 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  37.96 
 
 
287 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  37.45 
 
 
287 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  39.05 
 
 
284 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  36.1 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  35.74 
 
 
282 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  35.11 
 
 
278 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  33.92 
 
 
289 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  34.66 
 
 
276 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  32.84 
 
 
281 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  36.69 
 
 
278 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  33.95 
 
 
284 aa  177  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  36.2 
 
 
281 aa  175  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  34.93 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  34.56 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  29.71 
 
 
279 aa  165  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  33.33 
 
 
282 aa  163  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  29.09 
 
 
278 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  29.6 
 
 
276 aa  158  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  32.61 
 
 
285 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  29.43 
 
 
286 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  34.31 
 
 
275 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  35.51 
 
 
276 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  27.31 
 
 
276 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  28.83 
 
 
285 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  26.55 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  25.63 
 
 
289 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  31.9 
 
 
292 aa  143  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  26.15 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  29.09 
 
 
285 aa  136  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  32.28 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  31.83 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  31.83 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  31.49 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  31.83 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  31.49 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  31.83 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  31.49 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  27.64 
 
 
282 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  31.36 
 
 
282 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  31.93 
 
 
282 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  30.74 
 
 
282 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  40 
 
 
164 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  29.14 
 
 
282 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  30.07 
 
 
282 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  30.07 
 
 
282 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  28.1 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  33.64 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  27.91 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  27.91 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  26.15 
 
 
282 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  27.14 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  24.13 
 
 
304 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  26.2 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.45 
 
 
897 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  32.77 
 
 
891 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  32.77 
 
 
550 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  31.93 
 
 
891 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  36 
 
 
892 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  31.93 
 
 
891 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  31.93 
 
 
891 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  31.93 
 
 
891 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  31.93 
 
 
891 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  35 
 
 
891 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  35 
 
 
891 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  27.68 
 
 
892 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  30.91 
 
 
661 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  28.67 
 
 
680 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  24.88 
 
 
741 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  33.78 
 
 
692 aa  49.3  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.49 
 
 
646 aa  49.3  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  26.47 
 
 
901 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  35.37 
 
 
648 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  30.53 
 
 
651 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  30.53 
 
 
651 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  26.32 
 
 
655 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31 
 
 
977 aa  43.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  33.78 
 
 
681 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  24.71 
 
 
674 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>