77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4205 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 		 278 aa  323  9e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  100 
 
 		 278 aa  323  9e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  100 
 
 		 278 aa  323  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  100 
 
 		 278 aa  323  9e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  98.72 
 
 		 278 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  98.72 
 
 		 278 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  66.88 
 
 		 277 aa  215  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  63.87 
 
 		 284 aa  197  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  61.29 
 
 		 283 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  59.35 
 
 		 287 aa  191  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  60 
 
 		 287 aa  191  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  50.32 
 
 		 276 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  47.4 
 
 		 282 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  45.16 
 
 		 276 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  47.4 
 
 		 282 aa  148  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  43.51 
 
 		 280 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  41.82 
 
 		 278 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  42.42 
 
 		 278 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  43.23 
 
 		 283 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  40 
 
 		 279 aa  130  9e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  40.76 
 
 		 281 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  38.82 
 
 		 281 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  37.42 
 
 		 286 aa  121  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  37.5 
 
 		 289 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  39.47 
 
 		 285 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  42.95 
 
 		 276 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  37.18 
 
 		 284 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  36.84 
 
 		 276 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  37.66 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  33.77 
 
 		 279 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  34.84 
 
 		 282 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  34.84 
 
 		 282 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  34.84 
 
 		 282 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  34.84 
 
 		 282 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  34.84 
 
 		 282 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  34.84 
 
 		 282 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  34.84 
 
 		 282 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  35.48 
 
 		 282 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  34.84 
 
 		 282 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  34.84 
 
 		 282 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  34 
 
 		 313 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  36.42 
 
 		 276 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  34 
 
 		 311 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  36.18 
 
 		 282 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  34.19 
 
 		 285 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  37.01 
 
 		 289 aa  107  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  34.84 
 
 		 282 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  35.22 
 
 		 281 aa  97.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  31.61 
 
 		 285 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  30.97 
 
 		 282 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  27.45 
 
 		 282 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  30.95 
 
 		 292 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  32.24 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  30.32 
 
 		 282 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  30.26 
 
 		 279 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  31.85 
 
 		 282 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  30.32 
 
 		 282 aa  86.3  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  34.19 
 
 		 285 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  32.26 
 
 		 274 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  29.22 
 
 		 279 aa  85.5  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 283 aa  74.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  28.99 
 
 		 283 aa  74.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  28.57 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  29.33 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  28.72 
 
 		 977 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  30.43 
 
 		 624 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  30.43 
 
 		 624 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  33.9 
 
 		 692 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  29.21 
 
 		 741 aa  42.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  32.84 
 
 		 648 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  32.2 
 
 		 646 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  24.44 
 
 		 892 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26 
 
 		 661 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  24.14 
 
 		 901 aa  41.2  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  27.12 
 
 		 623 aa  41.2  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  27.93 
 
 		 681 aa  40.8  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>