102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0978 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 		 313 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  97.36 
 
 		 311 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  66.19 
 
 		 279 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  41.73 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  42.07 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  41.91 
 
 		 282 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  44.32 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  39.71 
 
 		 287 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  41.97 
 
 		 276 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  39.35 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  40.14 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  37.73 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  38.63 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  36.5 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  35.74 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  38.32 
 
 		 278 aa  201  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  31.87 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  36.59 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  38.46 
 
 		 281 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  38.57 
 
 		 281 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  38.35 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  31.14 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  36.16 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  31.25 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  34.81 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  32.97 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  32.97 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  32.97 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  32.97 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  33.09 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  32.97 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  32.97 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  30.47 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  34.28 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  32.1 
 
 		 282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  32.1 
 
 		 282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  31.73 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  31.37 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  31.37 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  31.37 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  31.37 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  31.37 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  31.37 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  31.37 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  31.37 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  33.7 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  34.56 
 
 		 279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  31.18 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  28.21 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  33.09 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  30.18 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  32.75 
 
 		 282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  31.65 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  31.34 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  28.36 
 
 		 289 aa  148  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  30.39 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  28.16 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  32.84 
 
 		 274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  31.78 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  31.78 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  29.04 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  28.12 
 
 		 282 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  25.71 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  34 
 
 		 164 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  25 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  21.43 
 
 		 652 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.74 
 
 		 977 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  25.82 
 
 		 646 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  42.19 
 
 		 674 aa  53.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  28.12 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.42 
 
 		 646 aa  52.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  22.22 
 
 		 692 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  26.84 
 
 		 646 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  24.73 
 
 		 646 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  29.59 
 
 		 892 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  25.79 
 
 		 646 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  26.32 
 
 		 643 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  25.26 
 
 		 646 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  25.26 
 
 		 646 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  25.26 
 
 		 646 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  25.26 
 
 		 646 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.56 
 
 		 661 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.28 
 
 		 696 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  26.03 
 
 		 655 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  29.9 
 
 		 705 aa  46.6  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  23.2 
 
 		 646 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  32.79 
 
 		 648 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3633  stationary phase inducible protein CsiE  38.81 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  30 
 
 		 680 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  20.52 
 
 		 517 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  24.18 
 
 		 891 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28.32 
 
 		 625 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  24.18 
 
 		 550 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  25.27 
 
 		 897 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  24.18 
 
 		 892 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  24.18 
 
 		 891 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  23.08 
 
 		 891 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  23.08 
 
 		 891 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  23.08 
 
 		 891 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  23.08 
 
 		 891 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>