199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0391 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
651 aa  1340    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  100 
 
 
651 aa  1340    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  28.07 
 
 
705 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  28.74 
 
 
652 aa  217  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  28.05 
 
 
741 aa  216  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  25.58 
 
 
701 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.67 
 
 
714 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  24.74 
 
 
701 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  25.69 
 
 
692 aa  196  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.92 
 
 
696 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.66 
 
 
709 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  25.25 
 
 
681 aa  176  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  27.11 
 
 
648 aa  174  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  27.02 
 
 
710 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  27.02 
 
 
710 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.39 
 
 
661 aa  170  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.39 
 
 
703 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  26.03 
 
 
655 aa  168  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  26.01 
 
 
646 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  26.01 
 
 
646 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  26.01 
 
 
646 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  25.81 
 
 
646 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  27.18 
 
 
643 aa  162  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  26.16 
 
 
646 aa  161  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  26.98 
 
 
646 aa  160  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  25.58 
 
 
646 aa  160  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  25.64 
 
 
612 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  25.2 
 
 
516 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  25.64 
 
 
516 aa  156  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  27.15 
 
 
517 aa  154  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  24.82 
 
 
646 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  25.2 
 
 
646 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.61 
 
 
670 aa  147  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.03 
 
 
696 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.38 
 
 
705 aa  145  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  23.67 
 
 
642 aa  144  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  24.2 
 
 
687 aa  140  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  24.42 
 
 
688 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.1 
 
 
625 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.89 
 
 
712 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  25.48 
 
 
684 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  24.05 
 
 
680 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  23.28 
 
 
698 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  23.28 
 
 
698 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  23.16 
 
 
698 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  24.2 
 
 
685 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.48 
 
 
683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  22.4 
 
 
678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  22.03 
 
 
689 aa  127  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  23.82 
 
 
639 aa  124  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.44 
 
 
646 aa  124  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  21.57 
 
 
637 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.16 
 
 
641 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  22.13 
 
 
637 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  22.24 
 
 
656 aa  122  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  21.37 
 
 
637 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  21.73 
 
 
637 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  21.37 
 
 
637 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  21.72 
 
 
663 aa  120  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.52 
 
 
636 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  22.53 
 
 
685 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  20.11 
 
 
638 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.79 
 
 
627 aa  114  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  19.6 
 
 
636 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  20.87 
 
 
674 aa  110  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  21.73 
 
 
710 aa  107  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  24.25 
 
 
623 aa  102  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  22.08 
 
 
557 aa  101  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  24.42 
 
 
496 aa  93.2  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.73 
 
 
628 aa  92.8  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1440  mannitol-specific cryptic phosphotransferase enzyme IIA component  37.59 
 
 
147 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000613996  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1548  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.59 
 
 
147 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  20.51 
 
 
559 aa  89.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  20.76 
 
 
668 aa  87.8  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0342  phosphotransferase enzyme II, A component  39.5 
 
 
147 aa  88.2  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000158392  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1524  transcriptional antiterminator, BglG  21.85 
 
 
513 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000100792  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  27.32 
 
 
624 aa  82  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  27.32 
 
 
624 aa  82  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2057  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.1 
 
 
147 aa  80.5  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.761537  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3548  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.76 
 
 
147 aa  77.8  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0778  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.08 
 
 
153 aa  77.4  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2491  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.54 
 
 
144 aa  76.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0779961  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1286  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.43 
 
 
151 aa  76.3  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000771  PTS system IIA component  31.45 
 
 
147 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0501  PTS system L-ascorbate family IIA subunit  31.71 
 
 
147 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.114156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0489  putative PTS system enzyme IIA component protein  31.2 
 
 
147 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3633  stationary phase inducible protein CsiE  22.51 
 
 
421 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673534  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1739  transcriptional antiterminator  20.9 
 
 
470 aa  65.5  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000739746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1464  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.27 
 
 
149 aa  65.1  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1267  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  30.58 
 
 
149 aa  64.3  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0108349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2846  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.43 
 
 
147 aa  64.3  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000475828  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  24.86 
 
 
285 aa  64.3  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2573  PTS family enzyme IIA, mannitol-specific, cryptic  28.8 
 
 
147 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0964884  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2485  PTS family enzyme IIA, mannitol-specific, cryptic  28.8 
 
 
147 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000956027  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2585  PTS family enzyme IIA, mannitol-specific, cryptic  28.8 
 
 
147 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.107526  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2531  PTS family enzyme IIA, mannitol-specific, cryptic  28.8 
 
 
147 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0875376  normal  0.425246 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3188  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.85 
 
 
151 aa  63.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192348  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2694  PTS system mannitol-specific transporter subunit IIA  28.8 
 
 
147 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.637925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0117  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.75 
 
 
158 aa  63.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0354562  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0825  putative phosphotransferase enzyme II, A component  30.16 
 
 
149 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.212876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>