87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2227 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  100 
 
 
710 aa  1451    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  100 
 
 
710 aa  1451    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  30.47 
 
 
696 aa  265  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  32.18 
 
 
692 aa  240  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  27.35 
 
 
652 aa  200  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  30.21 
 
 
741 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  28.4 
 
 
685 aa  184  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  27.52 
 
 
661 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  25.91 
 
 
680 aa  173  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  27.02 
 
 
651 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  27.02 
 
 
651 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  26.27 
 
 
648 aa  170  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  25.28 
 
 
701 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  27.54 
 
 
705 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  26.42 
 
 
612 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  24.86 
 
 
701 aa  142  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  25.99 
 
 
646 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  26.02 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  26.02 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  26.02 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  24.6 
 
 
674 aa  132  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  25.77 
 
 
646 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  25.51 
 
 
646 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.4 
 
 
714 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  25.61 
 
 
646 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  26.16 
 
 
643 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  26.18 
 
 
646 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  26.6 
 
 
655 aa  126  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.77 
 
 
646 aa  126  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  25.41 
 
 
646 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  25.2 
 
 
517 aa  124  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.66 
 
 
709 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  24.9 
 
 
516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  24.9 
 
 
516 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  23.36 
 
 
637 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  23.17 
 
 
637 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  23.17 
 
 
637 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.49 
 
 
625 aa  115  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  23.17 
 
 
637 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  22.97 
 
 
637 aa  114  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.3 
 
 
703 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.95 
 
 
705 aa  101  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  23.21 
 
 
663 aa  99.8  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  24.14 
 
 
681 aa  99.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.81 
 
 
628 aa  99.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  21.47 
 
 
623 aa  96.3  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.5 
 
 
627 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.38 
 
 
636 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  25.65 
 
 
496 aa  92  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  22.39 
 
 
636 aa  90.5  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  21.29 
 
 
656 aa  89  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  21.73 
 
 
638 aa  86.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  25.06 
 
 
668 aa  86.3  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  21.54 
 
 
684 aa  85.1  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.35 
 
 
712 aa  84.3  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  22.57 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1524  transcriptional antiterminator, BglG  21.76 
 
 
513 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000100792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.18 
 
 
696 aa  82.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.95 
 
 
641 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  25.2 
 
 
685 aa  80.5  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.84 
 
 
683 aa  78.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  22.48 
 
 
698 aa  77.4  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  22.48 
 
 
698 aa  77.4  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  27.2 
 
 
559 aa  76.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1739  transcriptional antiterminator  34.84 
 
 
470 aa  74.3  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000739746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  26.58 
 
 
689 aa  73.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  21.39 
 
 
688 aa  72  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  24.36 
 
 
678 aa  71.2  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  21.94 
 
 
687 aa  70.1  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  23.4 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  22.38 
 
 
642 aa  69.3  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  22.25 
 
 
698 aa  67.8  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.13 
 
 
670 aa  65.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0028  transcriptional antiterminator  24.74 
 
 
644 aa  63.9  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  26.63 
 
 
624 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  26.63 
 
 
624 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  22.17 
 
 
710 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3633  stationary phase inducible protein CsiE  27.5 
 
 
421 aa  54.3  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673534  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  27.36 
 
 
282 aa  52.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  27.36 
 
 
282 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1161  stationary phase inducible protein CsiE  34.69 
 
 
453 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018222  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1270  stationary phase inducible protein CsiE  34.69 
 
 
453 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00156699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0443  stationary phase inducible protein CsiE  34.69 
 
 
448 aa  47.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000142576  hitchhiker  0.00000119159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0655  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  21.09 
 
 
645 aa  46.6  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  26.88 
 
 
283 aa  45.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  26.88 
 
 
283 aa  45.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3033  stationary phase inducible protein CsiE  24.75 
 
 
425 aa  43.9  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129914  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>