94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3997 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3997  putative PTS regulatory protein  100 
 
 		 517 aa  1061    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0328  transcriptional antiterminator, BglG  58.4 
 
 		 516 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.341151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0336  transcriptional antiterminator, BglG  58.48 
 
 		 516 aa  611  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2754  transcriptional antiterminator, BglG  39.69 
 
 		 655 aa  368  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  27.29 
 
 		 652 aa  196  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28.43 
 
 		 661 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  26.55 
 
 		 741 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0232  transcriptional antiterminator  26.51 
 
 		 496 aa  179  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  27.31 
 
 		 692 aa  176  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  27.15 
 
 		 651 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  27.15 
 
 		 651 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0237  transcriptional antiterminator, BglG  25.24 
 
 		 705 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  25.88 
 
 		 648 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  25.1 
 
 		 696 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  26.61 
 
 		 674 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.85 
 
 		 625 aa  145  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  25.35 
 
 		 646 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  25.25 
 
 		 646 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  25.25 
 
 		 646 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  25.25 
 
 		 646 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  25.25 
 
 		 646 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2934  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.51 
 
 		 714 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  25 
 
 		 646 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  24.77 
 
 		 646 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  25.35 
 
 		 646 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  24.33 
 
 		 646 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  25.09 
 
 		 710 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  25.09 
 
 		 710 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  24.1 
 
 		 643 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  25.09 
 
 		 685 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  25.29 
 
 		 680 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.8 
 
 		 646 aa  119  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  23.96 
 
 		 663 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2664  BglG family transcriptional antiterminator  23.35 
 
 		 701 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1407  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.01 
 
 		 709 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.126789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2984  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  23.21 
 
 		 612 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00361591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2011  transcriptional antiterminator, BglG  24.25 
 
 		 701 aa  114  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0196  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.9 
 
 		 628 aa  109  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1382  transcriptional antiterminator, BglG  20.45 
 
 		 681 aa  105  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0103  HTH-type transcriptional regulator  21.56 
 
 		 656 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0134  transcriptional antiterminator, BglG  20.85 
 
 		 688 aa  97.8  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0038  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.34 
 
 		 703 aa  96.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.977169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1731  transcriptional antiterminator, BglG  23.25 
 
 		 698 aa  94.7  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  22.72 
 
 		 637 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  22.72 
 
 		 637 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  22.72 
 
 		 637 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  22.72 
 
 		 637 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  22.79 
 
 		 623 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3959  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.25 
 
 		 696 aa  91.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  22.47 
 
 		 637 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0916  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.75 
 
 		 636 aa  90.1  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.60605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0213  transcriptional antiterminator, BglG  23.59 
 
 		 678 aa  90.1  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  21.17 
 
 		 687 aa  90.1  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0686  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  24.05 
 
 		 627 aa  88.2  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00026813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0433  transcriptional antiterminator, BglG  23.53 
 
 		 636 aa  87.8  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  30.36 
 
 		 624 aa  87  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  30.36 
 
 		 624 aa  87  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1204  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  21.66 
 
 		 683 aa  86.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3151  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.64 
 
 		 641 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4372  transcriptional antiterminator, BglG  25.24 
 
 		 638 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180712  normal  0.327197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1524  transcriptional antiterminator, BglG  22.73 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000100792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1613  transcriptional antiterminator, BglG  25.61 
 
 		 689 aa  81.3  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3754  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.41 
 
 		 705 aa  77.4  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1151  transcriptional antiterminator, BglG  32.32 
 
 		 642 aa  77  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3187  transcriptional antiterminator, BglG  23.75 
 
 		 685 aa  74.3  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000270026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3555  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28.77 
 
 		 712 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1801  BglG family transcriptional antiterminator  21.21 
 
 		 559 aa  68.6  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1463  transcriptional antiterminator, BglG  22.48 
 
 		 684 aa  63.9  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0235  PRD domain-containing protein  20.53 
 
 		 698 aa  63.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0229  transcriptional antiterminator, BglG  20.53 
 
 		 698 aa  63.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1484  transcriptional antiterminator  27.61 
 
 		 668 aa  62  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.553371  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1351  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  26.29 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3177  transcriptional antiterminator, BglG  31.09 
 
 		 557 aa  57  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000121797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0194  BglG family transcriptional antiterminator  21.63 
 
 		 639 aa  56.2  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  23.68 
 
 		 282 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3160  transcriptional antiterminator, BglG  30.94 
 
 		 710 aa  56.2  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3443  transcriptional antiterminator, BglG  21.84 
 
 		 481 aa  53.9  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0084  capsule synthesis trans-acting positive regulator  20.09 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.905304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3966  transcriptional antiterminator, BglG  30.06 
 
 		 601 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  22.37 
 
 		 282 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  24.51 
 
 		 281 aa  50.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  21.83 
 
 		 311 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1739  transcriptional antiterminator  21.12 
 
 		 470 aa  47.8  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000739746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  21.94 
 
 		 275 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0655  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  18.69 
 
 		 645 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  20.52 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  25.83 
 
 		 282 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02427  stationary phase inducible protein  23.5 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02391  hypothetical protein  23.5 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.440596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1142  stationary phase inducible protein CsiE  23.5 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2821  stationary phase inducible protein CsiE  23.5 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00197749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2689  stationary phase inducible protein CsiE  23.5 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1133  transcriptional antiterminator, BglG  23.5 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3768  stationary phase inducible protein CsiE  23.5 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>