14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0005 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0005  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  176  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0005  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  176  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0005  hypothetical protein  62.5 
 
 
85 aa  104  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0005  hypothetical protein  60 
 
 
89 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.675199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2375  hypothetical protein  55.7 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0006  hypothetical protein  41.86 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0603717  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0005  hypothetical protein  49.38 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0005  hypothetical protein  46.34 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00704789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0004  hypothetical protein  44.05 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00050  hypothetical protein  43.04 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0004  hypothetical protein  40.74 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0832363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0006  YaaB  36.05 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000018271  unclonable  0.00000000524609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0004  hypothetical protein  38.27 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0005  hypothetical protein  29.41 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>