More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2325 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2325  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2467  hypothetical protein  95.75 
 
 		 306 aa  591  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 345 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  28.48 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0484  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  30.74 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2305  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  25.9 
 
 		 326 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  26.45 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  30.95 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1535  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  hitchhiker  0.00238453 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6204  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3365  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  28.8 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1595  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.12 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  28.52 
 
 		 508 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 507 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  30.4 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  24.21 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0310  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2696  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 322 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0100  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  0.148828 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  28.05 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  28.85 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  27.48 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1227  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.268765  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3164  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2551  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521467  decreased coverage  0.00635729 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2020  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1414  LysR family regulatory protein  27.46 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  25.74 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5282  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3434  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2971  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3073  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1042  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3200  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1329  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1485  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2309  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>