More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4097 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4097  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 90 aa  186  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  95.71 
 
 		 397 aa  141  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  79.71 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  78.26 
 
 		 391 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  60.23 
 
 		 404 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  77.94 
 
 		 389 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  68.12 
 
 		 410 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  68.12 
 
 		 409 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  65.22 
 
 		 396 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  57.97 
 
 		 411 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4839  hypothetical protein  57.97 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  59.42 
 
 		 275 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  59.42 
 
 		 422 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  56.52 
 
 		 421 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  53.62 
 
 		 404 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  56.52 
 
 		 419 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  52.17 
 
 		 404 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  52.17 
 
 		 404 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  61.76 
 
 		 395 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  57.97 
 
 		 420 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  56.52 
 
 		 334 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  69.57 
 
 		 387 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  60.29 
 
 		 421 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  56.52 
 
 		 420 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  56.52 
 
 		 421 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  53.62 
 
 		 406 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  57.97 
 
 		 404 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  59.42 
 
 		 397 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  56.52 
 
 		 404 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  56.52 
 
 		 404 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  60 
 
 		 419 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  60 
 
 		 419 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  49.28 
 
 		 421 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02760  hypothetical protein  53.62 
 
 		 319 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000757589  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  56.52 
 
 		 419 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  50.72 
 
 		 420 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  55.07 
 
 		 398 aa  83.6  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  55.71 
 
 		 402 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  52.17 
 
 		 425 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  55.07 
 
 		 421 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  53.62 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  50.72 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  57.81 
 
 		 438 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  55.07 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  53.62 
 
 		 394 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  55.07 
 
 		 401 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  53.62 
 
 		 394 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  54.29 
 
 		 401 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  58.46 
 
 		 404 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  57.35 
 
 		 403 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  53.62 
 
 		 391 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  55.07 
 
 		 418 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  55.07 
 
 		 418 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  52.17 
 
 		 404 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  55.07 
 
 		 419 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  52.17 
 
 		 425 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  52.17 
 
 		 424 aa  80.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  52.17 
 
 		 425 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  50.72 
 
 		 419 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  52.17 
 
 		 404 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  53.62 
 
 		 367 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  53.62 
 
 		 421 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  52.17 
 
 		 404 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  52.17 
 
 		 404 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  55.88 
 
 		 396 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  53.62 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  54.41 
 
 		 462 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  53.62 
 
 		 394 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  52.17 
 
 		 428 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  50.72 
 
 		 424 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  55.22 
 
 		 399 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  54.29 
 
 		 419 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  52.17 
 
 		 394 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  57.14 
 
 		 417 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  52.17 
 
 		 396 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  50.72 
 
 		 394 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  55.07 
 
 		 396 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  50.72 
 
 		 406 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1811  hypothetical protein  44.94 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.47307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  50 
 
 		 389 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  43.33 
 
 		 420 aa  77  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  49.28 
 
 		 404 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  53.62 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  50.72 
 
 		 402 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  53.73 
 
 		 400 aa  75.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  50 
 
 		 416 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  45.35 
 
 		 419 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  45.35 
 
 		 424 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  43.82 
 
 		 414 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  58.57 
 
 		 413 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  54.17 
 
 		 401 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  53.62 
 
 		 407 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  52.17 
 
 		 276 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  52.17 
 
 		 394 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  49.28 
 
 		 391 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3064  Phage integrase  54.41 
 
 		 438 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  52.17 
 
 		 420 aa  74.3  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  45.35 
 
 		 419 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  53.62 
 
 		 404 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  55.74 
 
 		 404 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>