46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2501 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  93.02 
 
 		 782 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0164  Rhs element Vgr protein  87.21 
 
 		 211 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000065374 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  80.23 
 
 		 782 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  79.07 
 
 		 782 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  79.07 
 
 		 782 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  74.42 
 
 		 782 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  81.08 
 
 		 832 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  74.32 
 
 		 900 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  76.92 
 
 		 835 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0809  hypothetical protein  88.64 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  53.42 
 
 		 787 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  42.86 
 
 		 843 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1019 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1019 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  32.56 
 
 		 477 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  34.67 
 
 		 843 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  34.88 
 
 		 952 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  40.68 
 
 		 843 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  44.44 
 
 		 911 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  43.64 
 
 		 1111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  43.64 
 
 		 1111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  32.84 
 
 		 842 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  35.14 
 
 		 852 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  43.64 
 
 		 1111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  43.64 
 
 		 1111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  35.06 
 
 		 783 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  40 
 
 		 612 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  42.59 
 
 		 897 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  38.89 
 
 		 847 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  32.94 
 
 		 918 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  33.8 
 
 		 822 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  30.56 
 
 		 920 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  33.9 
 
 		 835 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  33.78 
 
 		 1114 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  40 
 
 		 895 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  42.11 
 
 		 924 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  46 
 
 		 826 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  42.86 
 
 		 850 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  42.86 
 
 		 850 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  42.86 
 
 		 850 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  39.19 
 
 		 885 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  38.18 
 
 		 822 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 871 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  30.86 
 
 		 901 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  36.11 
 
 		 837 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>